RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 DEFB125Q8N687 156 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 OR2A7Q96R45 310 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ZNF320A2RRD8 509 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 HMX3A6NHT5 357 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 C2orf70A6NJV1 201 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 NOTOA8MTQ0 251 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 PPP5D1E7EU14 171 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 SCGNO76038 276 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 HRASP01112 189 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 CD7P09564 240 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 C22orf42Q6IC83 251 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 TPRA1Q86W33 373 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 MFSD4AQ8N468 514 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 OR4S2Q8NH73 311 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 CNBD2Q96M20 576 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 RETNQ9HD89 108 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 SPATA2Q9UM82 520 aa6.16□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 TMEM235A6NFC5 223 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 TEX22C9J3V5 150 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 KBTBD11O94819 623 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 NDUFB8O95169 186 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 DEFA4P12838 97 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 CBLN1P23435 193 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ARL3P36405 182 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 GNG2P59768 71 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 TNP2Q05952 138 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.15□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 TNCP24821 2201 aa6.15□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 SMIM30A4D0T7 59 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 A6NHS1 94 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 E7EUB6 86 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 IGLV2-14P01704 120 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 IGHV3-23P01764 117 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 CLEC3BP05452 202 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 CRYGCP07315 174 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 ZNF735P0CB33 412 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 AREGP15514 252 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 PSMB6P28072 239 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 SSX9Q7RTT3 188 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 OR4A5Q8NH83 315 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 CXorf58Q96LI9 332 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 SSR3Q9UNL2 185 aa6.14□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 SSX5O60225 188 aa6.13□□□□□ -1.43
COCH-211ENST00000557065 CTRB1P17538 263 aa6.13□□□□□ -1.43
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