RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556648.1

TMEM260-211, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 2

Gene TMEM260, Length 2,013 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-211ENST00000556648 H7C2Y5 167 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 CD3EP07766 207 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 COL8A2P25067 703 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 LOXP28300 417 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 REG1BP48304 166 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 DLX1P56177 255 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 KHDC3LQ587J8 217 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 C1orf87Q8N0U7 546 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 OR52E5Q8NH55 327 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 RAB39BQ96DA2 213 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 ZNF714Q96N38 554 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 PKDREJQ9NTG1 2253 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 DVL1O14640 695 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 OPN1MWP04001 364 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.27□□□□□ -1.09
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TMEM260-211ENST00000556648 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
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TMEM260-211ENST00000556648 ZNF429Q86V71 674 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.27□□□□□ -1.09
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TMEM260-211ENST00000556648 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa8.27□□□□□ -1.09
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TMEM260-211ENST00000556648 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.27□□□□□ -1.09
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TMEM260-211ENST00000556648 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.27□□□□□ -1.09
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TMEM260-211ENST00000556648 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.27□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.26□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa8.26□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa8.26□□□□□ -1.09
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TMEM260-211ENST00000556648 A0A1W2PRV1 198 aa8.26□□□□□ -1.09
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TMEM260-211ENST00000556648 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
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TMEM260-211ENST00000556648 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.26□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.26□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 C1orf159Q96HA4 380 aa8.26□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.26□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 HINT2Q9BX68 163 aa8.26□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.26□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 IGF2RP11717 2491 aa8.26□□□□□ -1.09
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TMEM260-211ENST00000556648 HEPN1Q6WQI6 88 aa8.25□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.25□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 FAM122AQ96E09 287 aa8.25□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 MGST2Q99735 147 aa8.25□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.25□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 KALRNO60229 2985 aa8.25□□□□□ -1.09
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TMEM260-211ENST00000556648 DLK1P80370 383 aa8.25□□□□□ -1.09
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TMEM260-211ENST00000556648 POU2AF1Q16633 256 aa8.25□□□□□ -1.09
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TMEM260-211ENST00000556648 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.25□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 TREML4Q6UXN2 200 aa8.25□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.25□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 YPEL4Q96NS1 127 aa8.25□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 B9A039 149 aa8.24□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 H0YJW9 148 aa8.24□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 UPK2O00526 184 aa8.24□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 HRASP01112 189 aa8.24□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 IFNA4P05014 189 aa8.24□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 C1QTNF9P0C862 333 aa8.24□□□□□ -1.09
TMEM260-211ENST00000556648 NPY1RP25929 384 aa8.24□□□□□ -1.09
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