RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556591.1

CFAP54-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 54, human

TSL 5

Gene CFAP54, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP54-208	ENST00000556591	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	FABP12	A6NFH5	140 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591		H3BT86	120 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	KRT75	O95678	551 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	CDK5R1	Q15078	307 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	SBSN	Q6UWP8	590 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	CHST6	Q9GZX3	395 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	MED9	Q9NWA0	146 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	CCL5	P13501	91 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	IL9	P15248	144 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	UGT2B7	P16662	529 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	CCR7	P32248	378 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	CTAG1A	P78358	180 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	ELOB	Q15370	118 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591		Q1T7F1	81 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	OR2T27	Q8NH04	317 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	KIF15	Q9NS87	1388 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	OR51F1	A6NGY5	319 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591		F5H768	121 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	HLA-DRA	P01903	254 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	PPBP	P02775	128 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	EVX1	P49640	407 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	TMED1	Q13445	227 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	KCTD7	Q96MP8	289 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	PRELID1	Q9Y255	219 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	GMEB1	Q9Y692	573 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CFAP54-208	ENST00000556591	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591		M0QX08	132 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	ORC5	O43913	435 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	MSMB	P08118	114 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	TFPT	P0C1Z6	253 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	UBE2G2	P60604	165 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM78B	Q5VT40	261 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591		Q8N2B8	174 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591		Q8N402	240 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	NAT8	Q9UHE5	227 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	GLI3	P10071	1580 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	POLE	Q07864	2286 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	NOTCH1	P46531	2555 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	HAAO	P46952	286 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM27B	Q5VT28	67 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	SSX8	Q7RTT4	187 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	GPR84	Q9NQS5	396 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	FBN2	P35556	2912 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	LST1	O00453	97 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	IL3	P08700	152 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	TRGC1	P0CF51	173 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	CCL1	P22362	96 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	SKP1	P63208	163 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	PPP1R1A	Q13522	171 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CFAP54-208	ENST00000556591	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		0.88	□□□□□ -2.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms