RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552433.1

LETMD1-233, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 2

Gene LETMD1, Length 727 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-233	ENST00000552433	LIM2	P55344	173 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	TPPP2	P59282	170 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	MYL5	Q02045	173 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	PDGFRL	Q15198	375 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	NRF1	Q16656	503 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	DEFB123	Q8N688	67 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	TMEM230	Q96A57	120 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	PARP11	Q9NR21	331 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	RPRM	Q9NS64	109 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	MARCH5	Q9NX47	278 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	BET1L	Q9NYM9	111 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433		A0A1B0GWB2	263 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433		A0A1W2PRS3	328 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF724	A8MTY0	619 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	NPFF	O15130	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	BCL2L11	O43521	198 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	IGKV5-2	P06315	115 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	OR12D1	P0DN82	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	BCL2	P10415	239 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	FGF6	P10767	208 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ERG	P11308	486 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	GM2A	P17900	193 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	GPM6A	P51674	278 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF85	Q03923	595 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	DHRS2	Q13268	280 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	DUSP5	Q16690	384 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433		Q6Q795	121 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433		Q6ZVQ6	151 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	OR2M3	Q8NG83	312 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	PRO3102	Q9H379	93 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	BANF2	Q9H503	90 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	JPT2	Q9H910	190 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	MYH4	Q9Y623	1939 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	NUP98	P52948	1817 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433		A0A087WZ39	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	GGT3P	A6NGU5	568 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	LINC01619	G3V211	115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ATP5G1	P05496	136 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	GZMB	P10144	247 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	BTG2	P78543	158 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	MMD	Q15546	238 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	SLC25A45	Q8N413	288 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	OR2T33	Q8NG76	320 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	RDH12	Q96NR8	316 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-233	ENST00000552433	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.98	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms