RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 LGALS7P47929 136 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 INPP1P49441 399 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 RPS16P62249 146 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 CBX3Q13185 183 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 PHLDA2Q53GA4 152 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 IDO2Q6ZQW0 420 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 ZFAND1Q8TCF1 268 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 MARCH1Q8TCQ1 289 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 SLC2A9Q9NRM0 540 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 RRHO14718 337 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 RAMP3O60896 148 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 FCGR3BO75015 233 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 LY86O95711 162 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 CRYZL1O95825 349 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 PI3P19957 117 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 S100GP29377 79 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 MYCNOSP40205 109 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 RND3P61587 244 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 CATR1Q13166 79 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 C5orf64Q2M2E5 130 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 OR2B11Q5JQS5 317 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 OR51H1Q8NH63 302 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 OR4S2Q8NH73 311 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 CD300LFQ8TDQ1 290 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 HARBI1Q96MB7 349 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 CITED4Q96RK1 184 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 GPR132Q9UNW8 380 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 PSMB11A5LHX3 300 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 NAP1L6A6NFF2 107 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 SHOXO15266 292 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 SPDEFO95238 335 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 IGLV2-23P01705 113 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 F2RP25116 425 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 PSG5Q15238 335 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 TBC1D26Q86UD7 250 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 SPAG16Q8N0X2 631 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 RASL11BQ9BPW5 248 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 EDA2RQ9HAV5 297 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 KIAA1456Q9P272 454 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 RYR1P21817 5038 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 MPPED1O15442 326 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 PLA2G10O15496 165 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 SLC25A17O43808 307 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 UPK1BO75841 260 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 IGHG2P01859 326 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 CRYGBP07316 175 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 PIGPP57054 158 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 POC5Q8NA72 575 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 FBXL15Q9H469 300 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 C5orf66Q9H5L9 145 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 LINC01548A6NM66 108 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 SEC14L6B5MCN3 397 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 CCL24O00175 119 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 HLA-DRB1P01911 266 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 BTCP35070 178 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 UBE2KP61086 200 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 IFITM3Q01628 133 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 RGS21Q2M5E4 152 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 ZNF585BQ52M93 769 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 LIN54Q6MZP7 749 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 SCGB3A2Q96PL1 93 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 HSPB9Q9BQS6 159 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 PLEKHA2Q9HB19 425 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 TPSG1Q9NRR2 321 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 COPZ2Q9P299 210 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 VSIG4Q9Y279 399 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 ALMS1Q8TCU4 4167 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 CENPXA8MT69 81 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 FCN1O00602 326 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 S1PR2O95136 353 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 HPRT1P00492 218 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 CCR6P51684 374 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 PLGLAQ15195 96 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 VMA21Q3ZAQ7 101 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 PPP1R27Q86WC6 154 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 TEX45Q8NA69 505 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 MINDY2Q8NBR6 621 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 CHPT1Q8WUD6 406 aa10.71□□□□□ -0.69
CS-231ENST00000552222 RHOVQ96L33 236 aa10.71□□□□□ -0.69
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