RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551594.1

CTDSP2-207, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP2, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-207ENST00000551594 CD28P10747 220 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 AKR1C4P17516 323 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 G6PCP35575 357 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 IFITM3Q01628 133 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 DNHD1Q96M86 4753 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 PSMB11A5LHX3 300 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 LYRM1O43325 122 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 UPK1BO75841 260 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 SERPINE2P07093 398 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 OR5AC1P0C628 307 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 TNXAQ16473 311 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 POU2AF1Q16633 256 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 ARPC1AQ92747 370 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 TMEM140Q9NV12 185 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 TBC1D24Q9ULP9 559 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 MARCH11A6NNE9 402 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 NDUFB6O95139 128 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 MYOD1P15172 320 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 ERVK-16P61578 105 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 ECSCRQ19T08 205 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 MMD2Q8IY49 270 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 VSTM2AQ8TAG5 236 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 CITED1Q99966 193 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 AIFM2Q9BRQ8 373 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 BET1LQ9NYM9 111 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 PRR13Q9NZ81 148 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 TRAV41A0A0B4J266 112 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 UPK2O00526 184 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 VDAC1P21796 283 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 UCP1P25874 307 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 TRIM16LQ309B1 348 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 SGPP2Q8IWX5 399 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 LFNGQ8NES3 379 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 GLYATL2Q8WU03 294 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 SEC22AQ96IW7 307 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 TMEM222Q9H0R3 208 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 MSGN1A6NI15 193 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 FBXO24O75426 580 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 OPN1MWP04001 364 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 OR9G9P0C7N8 305 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 APELAP0DMC3 54 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 CFHR3Q02985 330 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 LCNL1Q6ZST4 164 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF580Q9UK33 172 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 NSG2Q9Y328 171 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 E7EUB6 86 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 ACTL6BO94805 426 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 IGKV1-5P01602 117 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 PPIFP30405 207 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 RPL8P62917 257 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 SLC35B1P78383 322 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 ASAH1Q13510 395 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 TMEM187Q14656 261 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 OR4A5Q8NH83 315 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 B3GALNT1O75752 331 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 CDS2O95674 445 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 HLA-GP17693 338 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 DHODHQ02127 395 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 SLC25A42Q86VD7 318 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 GALNT14Q96FL9 552 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 PHB2Q99623 299 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 GON7Q9BXV9 100 aa14.71□□□□□ -0.05
CTDSP2-207ENST00000551594 A0A1B0GW64 132 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2-207ENST00000551594 A0A1W2PN81 502 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms