RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551459.5

RAB5B-209, Transcript of RAB5B, member RAS oncogene family, human

TSL 4

Gene RAB5B, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB5B-209	ENST00000551459	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	LYG1	Q8N1E2	194 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459		Q8N402	240 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	PRRT1	Q99946	306 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	RNF150	Q9ULK6	438 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	VWF	P04275	2813 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459		A0A1W2PPI3	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	CENPX	A8MT69	81 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	BET1	O15155	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	RAB3D	O95716	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	PPY	P01298	95 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	CSN3	P07498	182 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	FGF2	P09038	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	COX7A1	P24310	79 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	S100G	P29377	79 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	HRH1	P35367	487 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	LGALS7	P47929	136 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	THBS3	P49746	956 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	RAB13	P51153	203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	SST	P61278	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	BAMBI	Q13145	260 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	KLRD1	Q13241	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	SSX2	Q16385	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	PYDC2	Q56P42	97 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459		A0A1B0GUS0	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	RRH	O14718	337 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	FGF16	O43320	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	PROP1	O75360	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	MOS	P00540	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	CD3D	P04234	171 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	OR8U9	P0C7N5	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	PTHLH	P12272	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	HLA-DMA	P28067	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	RFX2	P48378	723 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	INPP1	P49441	399 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	GNG10	P50151	68 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	RND3	P61587	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms