RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-208	ENST00000546997	HRAS	P01112	189 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	IGHV1-46	P01743	117 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	CTXN2	P0C2S0	81 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	PLA2G2A	P14555	144 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	ERVK11-1	P61568	191 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	LCN2	P80188	198 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	BSX	Q3C1V8	233 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	FAM222B	Q8WU58	562 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	ZFP92	A6NM28	416 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997		H7BYZ3	331 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	PF4	P02776	101 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	SCT	P09683	121 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997		Q6P435	159 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	GAB2	Q9UQC2	676 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	CENPE	Q02224	2701 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	GALR1	P47211	349 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997		Q8IYB0	196 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	RDH5	Q92781	318 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	DEGS1	O15121	323 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	TUSC2	O75896	110 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	VENTX	O95231	258 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	OR10J1	P30954	320 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	EFNB3	Q15768	340 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	WDR82	Q6UXN9	313 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	DSCAM	O60469	2012 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	C17orf100	A8MU93	164 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	DLEU1	O43261	78 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	S100G	P29377	79 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	KIR2DS4	P43632	304 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	KIR2DS1	Q14954	304 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	HERPUD1	Q15011	391 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	MUC15	Q8N387	334 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	MB	P02144	154 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	HBG1	P69891	147 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	HBG2	P69892	147 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	CCL8	P80075	99 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF726P1	Q15940	193 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	USF3	Q68DE3	2245 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997		B9A039	149 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	CD99	P14209	185 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	MZT1	Q08AG7	82 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	ADIRF	Q15847	76 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	IL19	Q9UHD0	177 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	ARID1A	O14497	2285 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997		J3QKU1	62 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	WNT9B	O14905	357 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF737	O75373	536 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	OR2H2	O95918	312 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	ADH4	P08319	380 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	GATA4	P43694	442 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF146	Q15072	292 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	GCM1	Q9NP62	436 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997		A6NNC1	897 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	NXPH2	O95156	264 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	GZMH	P20718	246 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		13.65	□□□□□ -0.22

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