RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 SSX2Q16385 188 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 SSX9Q7RTT3 188 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 LYG1Q8N1E2 194 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 PARLQ9H300 379 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
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CS-205ENST00000546891 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 C11orf94C9JXX5 98 aa8.06□□□□□ -1.12
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CS-205ENST00000546891 TMPRSS2O15393 492 aa8.06□□□□□ -1.12
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CS-205ENST00000546891 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
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CS-205ENST00000546891 SPINK9Q5DT21 86 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.06□□□□□ -1.12
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CS-205ENST00000546891 OR4A47Q6IF82 309 aa8.06□□□□□ -1.12
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CS-205ENST00000546891 TEPPQ6URK8 271 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 TREML4Q6UXN2 200 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
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CS-205ENST00000546891 IMMP2LQ96T52 175 aa8.06□□□□□ -1.12
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CS-205ENST00000546891 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 DOK5Q9P104 306 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.06□□□□□ -1.12
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CS-205ENST00000546891 C17orf100A8MU93 164 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 UPK2O00526 184 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 SLC31A2O15432 143 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 PAGE4O60829 102 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 CLN5O75503 358 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 GYPAP02724 150 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 STAG3L2P0CL84 134 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 STAG3L3P0CL85 134 aa8.05□□□□□ -1.12
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CS-205ENST00000546891 ZNF134P52741 427 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 NDUFA6P56556 154 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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CS-205ENST00000546891 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.05□□□□□ -1.12
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CS-205ENST00000546891 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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CS-205ENST00000546891 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 OR51M1Q9H341 326 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 BET1LQ9NYM9 111 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 ZNF292O60281 2723 aa8.05□□□□□ -1.12
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CS-205ENST00000546891 PPP5D1E7EU14 171 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 RRHO14718 337 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 HIST1H2BKO60814 126 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 HIST1H2BJP06899 126 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 HIST1H2BOP23527 126 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 CCKARP32238 428 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 HIST1H2BBP33778 126 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 TDGF1P3P51864 188 aa8.04□□□□□ -1.12
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CS-205ENST00000546891 LINC00205P59089 165 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 B2MP61769 119 aa8.04□□□□□ -1.12
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CS-205ENST00000546891 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.04□□□□□ -1.12
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CS-205ENST00000546891 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.04□□□□□ -1.12
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CS-205ENST00000546891 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 UHRF2Q96PU4 802 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-205ENST00000546891 RNF2Q99496 336 aa8.04□□□□□ -1.12
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