RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 TNFRSF9Q07011 255 aa7.99□□□□□ -1.13
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PTPRB-204ENST00000538708 THADAQ6YHU6 1953 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRB-204ENST00000538708 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-204ENST00000538708 ZP3P21754 424 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-204ENST00000538708 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-204ENST00000538708 LINC01590Q5TEZ4 76 aa7.95□□□□□ -1.14
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