RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 RAB9AP51151 201 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 POU2AF1Q16633 256 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ETV3LQ6ZN32 361 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 SSX9Q7RTT3 188 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC190Q86UF4 302 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 BET1LQ9NYM9 111 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 CMYA5Q8N3K9 4069 aa14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 PGAM2P15259 253 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP5CP53041 499 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF79Q15937 498 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 OR4A47Q6IF82 309 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 TBC1D26Q86UD7 250 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF491Q8N8L2 437 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 OR4A5Q8NH83 315 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 TERB2Q8NHR7 220 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 C4orf3Q8WVX3 66 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 UBE2E2Q96LR5 201 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 PHB2Q99623 299 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 MSGN1A6NI15 193 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 DISC1C4P0D8 188 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 MAS1LP35410 378 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 MYCNOSP40205 109 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 RND3P61587 244 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 VSIG4Q9Y279 399 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 H3BUA1 57 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 CD33P20138 364 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 CD40LGP29965 261 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ETV6P41212 452 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 LPAR6P43657 344 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 RPL8P62917 257 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF585BQ52M93 769 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 PYDC2Q56P42 97 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM63Q969Q1 353 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 MRGPRFQ96AM1 343 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 P2RX4Q99571 388 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 SPIN2AQ99865 258 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 GNB4Q9HAV0 340 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 HRASLSQ9HDD0 168 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM140Q9NV12 185 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 MARCH11A6NNE9 402 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 APELAP0DMC3 54 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 PI3P19957 117 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ECI1P42126 302 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 PIGPP57054 158 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 TPPP2P59282 170 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ERVK-16P61578 105 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 DEFB136Q30KP8 78 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 Q8N402 240 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 LINC00482Q8N8I6 264 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 WFDC9Q8NEX5 89 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 OR5T1Q8NG75 326 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 RAX2Q96IS3 184 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-208ENST00000531226 CCL24O00175 119 aa14.77□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 UPK2O00526 184 aa14.77□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 MPPED1O15442 326 aa14.77□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 RUNX1Q01196 453 aa14.77□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.77□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 MS4A10Q96PG2 267 aa14.77□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 DUX3Q96PT4 197 aa14.77□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 PRRT1Q99946 306 aa14.77□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.77□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC2A8Q9NY64 477 aa14.77□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TRAV3A0A0B4J244 114 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 I3L521 148 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 BRI3O95415 125 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TRGV3P03979 118 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 FGF2P09038 288 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 OR9G9P0C7N8 305 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 RPA2P15927 270 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 HLA-GP17693 338 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 CADM3Q8N126 398 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.76□□□□□ -0.05
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