RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516666.1

RNU6-1332P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1332, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1332P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ACOT12Q8WYK0 555 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MROQ9BYG7 248 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NAT8Q9UHE5 227 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RIMS2Q9UQ26 1411 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1332P-201ENST00000516666 EML5Q05BV3 1969 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1332P-201ENST00000516666 A0A1W2PP64 1363 aa0.09□□□□□ -2.39
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 IRGMA1A4Y4 181 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 C5orf49A4QMS7 147 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 STX10O60499 249 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 APOMO95445 188 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KRT75O95678 551 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SHBGP04278 402 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 LCN1P31025 176 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HAAOP46952 286 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RPS24P62847 133 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HLA-DRB3P79483 266 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RUNX1Q01196 453 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RAB2BQ8WUD1 216 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 AQP3Q92482 292 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PPCDCQ96CD2 204 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RBP7Q96R05 134 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CCL13Q99616 98 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TMEM109Q9BVC6 243 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HES4Q9HCC6 221 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FUOMA2VDF0 154 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TRAPPC2LH3BP13 241 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 C19orf84I3L1E1 186 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 COCHO43405 550 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TFPTP0C1Z6 253 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 UBBP0CG47 229 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CD40LGP29965 261 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SMAGPQ0VAQ4 97 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZNF345Q14585 488 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 COPS6Q7L5N1 327 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SPATA24Q86W54 205 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 C1orf109Q9NX04 203 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 COL4A5P29400 1685 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HEATR5AQ86XA9 2040 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 C21orf140B9A014 251 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CCRL2O00421 344 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SLC22A1O15245 554 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PMP2P02689 132 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 DDTP30046 118 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KDELR2P33947 212 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RPL30P62888 115 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SLAMF1Q13291 335 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 Q8N6K4 173 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZNF676Q8N7Q3 588 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 OR5L1Q8NGL2 311 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ASB13Q8WXK3 278 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 BAIAP2Q9UQB8 552 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PRELID1Q9Y255 219 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KIF24Q5T7B8 1368 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TMEM212A6NML5 194 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 COX7A2LO14548 114 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PRH1P02810 166 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SULT1A3P0DMM9 295 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SULT1A4P0DMN0 295 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CXCL2P19875 107 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SYT1P21579 422 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 DMTNQ08495 405 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 C4orf26Q17RF5 130 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HLA-DRB5Q30154 266 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 Q3ZCU0 254 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 DNAL1Q4LDG9 190 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 OR7G1Q8NGA0 311 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SMR3AQ99954 134 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 C10orf95Q9H7T3 257 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CFAP45Q9UL16 551 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TIMM22Q9Y584 194 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RP1P56715 2156 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MAST4O15021 2626 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 AZIN1O14977 448 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 LEPROTO15243 131 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NSA2O95478 260 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 C1QAP02745 245 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 IL6P05231 212 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 S100A9P06702 114 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CXCL3P19876 107 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CD151P48509 253 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZNF846Q147U1 533 aa0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms