RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-215	ENST00000514625	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	PYDC2	Q56P42	97 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	OR4A5	Q8NH83	315 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	COMMD9	Q9P000	198 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	VSIG4	Q9Y279	399 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	PLXNB1	O43157	2135 aa		13.97	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	SOX15	O60248	233 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	ECI1	P42126	302 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	LPAR6	P43657	344 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	PPP5C	P53041	499 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	OR4A47	Q6IF82	309 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	OR5T1	Q8NG75	326 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625	BET1L	Q9NYM9	111 aa		13.96	□□□□□ -0.17
FAAP20-215	ENST00000514625		H3BUA1	57 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	S1PR2	O95136	353 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	POU2AF1	Q16633	256 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	MS4A10	Q96PG2	267 aa		13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	CCL24	O00175	119 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	TRGV3	P03979	118 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	PIGP	P57054	158 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	TPPP2	P59282	170 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	RND3	P61587	244 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	CCDC190	Q86UF4	302 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625		Q8N402	240 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	PRRT1	Q99946	306 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	TMEM140	Q9NV12	185 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	COPZ2	Q9P299	210 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625		V9GYH0	126 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	MARCH11	A6NNE9	402 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	ZNF735	P0CB33	412 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	APELA	P0DMC3	54 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	HLA-G	P17693	338 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	AP3S2	P59780	193 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	DEFB136	Q30KP8	78 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	RAX2	Q96IS3	184 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	GNB4	Q9HAV0	340 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	COA4	Q9NYJ1	87 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	UPK2	O00526	184 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	KRAS	P01116	189 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	SERPINE2	P07093	398 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	OR9G9	P0C7N8	305 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	RPA2	P15927	270 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	PI3	P19957	117 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	ETV6	P41212	452 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	RAB25	P57735	213 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	ZNF585B	Q52M93	769 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	DUX3	Q96PT4	197 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	OR5B12	Q96R08	314 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	P2RX4	Q99571	388 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	MCUB	Q9NWR8	336 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625		A0A0G2JLM5	398 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	SNAPC5	O75971	98 aa		13.91	□□□□□ -0.18

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms