RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 OSTCQ9NRP0 149 aa7.41□□□□□ -1.22
GPBP1-208ENST00000514387 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.41□□□□□ -1.22
GPBP1-208ENST00000514387 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.41□□□□□ -1.22
GPBP1-208ENST00000514387 A0A0G2JRQ6 117 aa7.4□□□□□ -1.22
GPBP1-208ENST00000514387 AMY1AP04745 511 aa7.4□□□□□ -1.22
GPBP1-208ENST00000514387 UCNP55089 124 aa7.4□□□□□ -1.22
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GPBP1-208ENST00000514387 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
GPBP1-208ENST00000514387 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
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GPBP1-208ENST00000514387 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.4□□□□□ -1.22
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.4□□□□□ -1.22
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GPBP1-208ENST00000514387 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
GPBP1-208ENST00000514387 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
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GPBP1-208ENST00000514387 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.4□□□□□ -1.22
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GPBP1-208ENST00000514387 TSKUQ8WUA8 353 aa7.4□□□□□ -1.22
GPBP1-208ENST00000514387 RNF138Q8WVD3 245 aa7.4□□□□□ -1.22
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GPBP1-208ENST00000514387 E9PLN8 166 aa7.39□□□□□ -1.23
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GPBP1-208ENST00000514387 RUNX3Q13761 415 aa7.39□□□□□ -1.23
GPBP1-208ENST00000514387 OCC1Q8TAD7 63 aa7.39□□□□□ -1.23
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GPBP1-208ENST00000514387 RNF114Q9Y508 228 aa7.39□□□□□ -1.23
GPBP1-208ENST00000514387 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.39□□□□□ -1.23
GPBP1-208ENST00000514387 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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GPBP1-208ENST00000514387 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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GPBP1-208ENST00000514387 IGKV1D-12P01611 117 aa7.39□□□□□ -1.23
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GPBP1-208ENST00000514387 Q6ZRM9 215 aa7.38□□□□□ -1.23
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GPBP1-208ENST00000514387 RNF183Q96D59 192 aa7.38□□□□□ -1.23
GPBP1-208ENST00000514387 V9GYV3 84 aa7.38□□□□□ -1.23
GPBP1-208ENST00000514387 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.38□□□□□ -1.23
GPBP1-208ENST00000514387 RAB29O14966 203 aa7.38□□□□□ -1.23
GPBP1-208ENST00000514387 LINC00271P0C7V0 271 aa7.38□□□□□ -1.23
GPBP1-208ENST00000514387 CD27P26842 260 aa7.38□□□□□ -1.23
GPBP1-208ENST00000514387 COMMD5Q9GZQ3 224 aa7.38□□□□□ -1.23
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