RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 HSD17B6O14756 317 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 TIMM23O14925 209 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 OR4E1P0C645 316 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 IGHV1-8P0DP01 117 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 CCL3L1P16619 93 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 PRTN3P24158 256 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 CEACAM3P40198 252 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 ARHGDIBP52566 201 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 PIGPP57054 158 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 RND3P61587 244 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 ARF6P62330 175 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 DHODHQ02127 395 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 BAMBIQ13145 260 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 CBX3Q13185 183 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 PHLDA2Q53GA4 152 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 GLCCI1Q86VQ1 547 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 ABHD12Q8N2K0 398 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 FGFRL1Q8N441 504 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 TEX29Q8N6K0 151 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 OR9G1Q8NH87 305 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 CD300LFQ8TDQ1 290 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 UPRTQ96BW1 309 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 CYYR1Q96J86 154 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 PHB2Q99623 299 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 SUCNR1Q9BXA5 334 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 CLEC7AQ9BXN2 247 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 FXYD6Q9H0Q3 95 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 MED28Q9H204 178 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 OR2D2Q9H210 308 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 OR51J1Q9H342 316 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 HIF1ANQ9NWT6 349 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 GAB2Q9UQC2 676 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 VSIG4Q9Y279 399 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-210ENST00000512194 TANC2Q9HCD6 1990 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 J3QR06 171 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 PFDN1O60925 122 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 CRLF1O75462 422 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 IFNA21P01568 189 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 SERPINE2P07093 398 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 MSMBP08118 114 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 CD34P28906 385 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 GNRHRP30968 328 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 KIR2DS2P43631 304 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 AMTP48728 403 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 GNG10P50151 68 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 GNMTQ14749 295 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 TCF23Q7RTU1 214 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 LYG2Q86SG7 212 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 LGI3Q8N145 548 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 LYG1Q8N1E2 194 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 LINC00311Q8N616 119 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 UXS1Q8NBZ7 420 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 CASTOR1Q8WTX7 329 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 TMEM186Q96B77 213 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 BEX2Q9BXY8 128 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 REG4Q9BYZ8 158 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 C5orf66Q9H5L9 145 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 NAA60Q9H7X0 242 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 BEX1Q9HBH7 125 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 LPAR2Q9HBW0 351 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 CCL28Q9NRJ3 127 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 SLC2A9Q9NRM0 540 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 RNF150Q9ULK6 438 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 ALG5Q9Y673 324 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 A0A0B4J2A0 478 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 C9orf170A2RU37 121 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 C7orf66A4D0T2 115 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 VGLL3A8MV65 326 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 LEUTXA8MZ59 168 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 J3QLI3 93 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 TXNL1O43396 289 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 SFT2D2O95562 160 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 TOMM40O96008 361 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 TRAPPC2P0DI81 140 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 TRAPPC2BP0DI82 140 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 RRASP10301 218 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 RPA2P15927 270 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 THBS3P49746 956 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 DLX6P56179 175 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 DHRS2Q13268 280 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 PPP1R1AQ13522 171 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms