RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 NPIPB5A8MRT5 1133 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 IGHV3-23P01764 117 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 EDN2P20800 178 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 ANKRD55Q3KP44 614 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 CLEC19AQ6UXS0 136 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 OR52B4Q8NGK2 314 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 OR4S2Q8NH73 311 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 SLC2A9Q9NRM0 540 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 DMRT1Q9Y5R6 373 aa12.3□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 TEX22C9J3V5 150 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 KBTBD11O94819 623 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 HLA-DQB1P01920 261 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 RAB3BP20337 219 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 CRHBPP24387 322 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 MAS1LP35410 378 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 RPL30P62888 115 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 SSX1Q16384 188 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 CDNFQ49AH0 187 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM61Q8N0U2 210 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 CACNG8Q8WXS5 425 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 GGTLC1Q9BX51 225 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 SPATA2Q9UM82 520 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 SELENOKQ9Y6D0 94 aa12.29□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 NDUFB8O95169 186 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 DEFA4P12838 97 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 OR4A47Q6IF82 309 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 UXS1Q8NBZ7 420 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 DCSTAMPQ9H295 470 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 BLOC1S6Q9UL45 172 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 S4R3C0 116 aa12.28□□□□□ -0.44
ITGA3-211ENST00000508100 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 HRASP01112 189 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 AREGP15514 252 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 PSMB6P28072 239 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 HACD4Q5VWC8 232 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 CNIH2Q6PI25 160 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 C19orf35Q6ZS72 473 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF367Q7RTV3 350 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 CCDC140Q96MF4 163 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 FANCD2OSQ96PS1 177 aa12.27□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM213A2RRL7 107 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 E7EUB6 86 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 IGLV2-14P01704 120 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 CRYGCP07315 174 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF735P0CB33 412 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 IGKV1-13P0DP09 117 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 GABARAPL2P60520 117 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 RPL8P62917 257 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF66Q6ZN08 573 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 SSX9Q7RTT3 188 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 CXorf58Q96LI9 332 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 OVOL2Q9BRP0 275 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 AIFM2Q9BRQ8 373 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 TAS2R8Q9NYW2 309 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 MLXQ9UH92 298 aa12.26□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa12.25□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa12.25□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 CXorf65A6NEN9 183 aa12.25□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 A8MWP6 167 aa12.25□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 LY6G6CO95867 125 aa12.25□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 CLEC3BP05452 202 aa12.25□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 GNG2P59768 71 aa12.25□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 TM4SF20Q53R12 229 aa12.25□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 BTNL8Q6UX41 500 aa12.25□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 MFSD4AQ8N468 514 aa12.25□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa12.25□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00476Q8WZB0 136 aa12.25□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 MARC2Q969Z3 335 aa12.25□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 NDUFB11Q9NX14 153 aa12.25□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 TRAV25A0A0B4J276 109 aa12.24□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM235A6NFC5 223 aa12.24□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 SCGNO76038 276 aa12.24□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 REG1AP05451 166 aa12.24□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 CTRB1P17538 263 aa12.24□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 HLA-GP17693 338 aa12.24□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 PMS2P11Q13670 270 aa12.24□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 CTRB2Q6GPI1 263 aa12.24□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 C22orf42Q6IC83 251 aa12.24□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 OR1L6Q8NGR2 347 aa12.24□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 HRASLSQ9HDD0 168 aa12.24□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 ANXA10Q9UJ72 324 aa12.24□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 A0A1B0GW64 132 aa12.23□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 SMIM30A4D0T7 59 aa12.23□□□□□ -0.45
ITGA3-211ENST00000508100 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.8 ms