RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 ATP5G3P48201 142 aa11.15□□□□□ -0.62
SPCS3-201ENST00000503362 Q6ZRM9 215 aa11.15□□□□□ -0.62
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SPCS3-201ENST00000503362 KLHDC1Q8N7A1 406 aa11.15□□□□□ -0.62
SPCS3-201ENST00000503362 OR1L4Q8NGR5 311 aa11.15□□□□□ -0.62
SPCS3-201ENST00000503362 OR1L8Q8NGR8 309 aa11.15□□□□□ -0.62
SPCS3-201ENST00000503362 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SPCS3-201ENST00000503362 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.15□□□□□ -0.62
SPCS3-201ENST00000503362 GP6Q9HCN6 339 aa11.15□□□□□ -0.62
SPCS3-201ENST00000503362 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa11.15□□□□□ -0.62
SPCS3-201ENST00000503362 USF1P22415 310 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SPCS3-201ENST00000503362 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
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SPCS3-201ENST00000503362 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa11.14□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM50AO95807 157 aa11.14□□□□□ -0.63
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SPCS3-201ENST00000503362 HSPB9Q9BQS6 159 aa11.14□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 IQCF6A8MYZ5 107 aa11.14□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa11.14□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 TCAPO15273 167 aa11.14□□□□□ -0.63
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SPCS3-201ENST00000503362 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 C10orf91Q5T1B1 145 aa11.14□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 IFNL4K9M1U5 179 aa11.14□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 IL18BPO95998 194 aa11.14□□□□□ -0.63
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SPCS3-201ENST00000503362 MBD3L1Q8WWY6 194 aa11.14□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 IGLV3-1P01715 115 aa11.13□□□□□ -0.63
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SPCS3-201ENST00000503362 FTH1P19P0C7X4 201 aa11.13□□□□□ -0.63
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SPCS3-201ENST00000503362 C1orf174Q8IYL3 243 aa11.13□□□□□ -0.63
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SPCS3-201ENST00000503362 MS4A5Q9H3V2 200 aa11.12□□□□□ -0.63
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SPCS3-201ENST00000503362 IGHV3-48P01763 117 aa11.12□□□□□ -0.63
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SPCS3-201ENST00000503362 NAGKQ9UJ70 344 aa11.12□□□□□ -0.63
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SPCS3-201ENST00000503362 LINC00869P0C866 280 aa11.12□□□□□ -0.63
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SPCS3-201ENST00000503362 WDR82Q6UXN9 313 aa11.12□□□□□ -0.63
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SPCS3-201ENST00000503362 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
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SPCS3-201ENST00000503362 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa11.11□□□□□ -0.63
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SPCS3-201ENST00000503362 ARL16Q0P5N6 197 aa11.11□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 COLCA1Q6ZS62 124 aa11.11□□□□□ -0.63
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SPCS3-201ENST00000503362 NHLRC2Q8NBF2 726 aa11.11□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 ABCA4P78363 2273 aa11.11□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa11.11□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 C16orf97H3BN30 126 aa11.11□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 COX19Q49B96 90 aa11.11□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa11.11□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 STARD4Q96DR4 205 aa11.11□□□□□ -0.63
SPCS3-201ENST00000503362 NABP2Q9BQ15 211 aa11.11□□□□□ -0.63
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