RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495893.6

PHC3-215, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PHC3, Length 12,666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-215ENST00000495893 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 GLRX2Q9NS18 164 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 CLEC1BQ9P126 229 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 PLXNB2O15031 1838 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 SERTM1A2A2V5 107 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 NDUFB3O43676 98 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 TMEM252Q8N6L7 170 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 OR11G2Q8NGC1 345 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 TWSG1Q9GZX9 223 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 C1RLQ9NZP8 487 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 PATJQ8NI35 1801 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 FFAR1O14842 300 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 LINC01565O15544 149 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 SYNGR3O43761 229 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 HBDP02042 147 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 TMEM25Q86YD3 366 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 FRG2CA6NGY1 282 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 TARM1B6A8C7 271 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 UPK1AO00322 258 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 NAPSAO96009 420 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 C8orf88P0DMB2 117 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 P2RY2P41231 377 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 LIMS1P48059 325 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 TM4SF20Q53R12 229 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 LINC00696Q6ZRV3 163 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 C20orf144Q9BQM9 153 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 EMC6Q9BV81 110 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 UCP3P55916 312 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 FBXW9Q5XUX1 488 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 ARPC1AQ92747 370 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 H0YIG0 161 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 NPFFO15130 113 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 GNB2P62879 340 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 IFITM3Q01628 133 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 SLC25A40Q8TBP6 338 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 FGF11Q92914 225 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 LRRC61Q9BV99 259 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 DENND4AQ7Z401 1863 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 A0A0B4J2E0 115 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 A0A1B0GX12 115 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 MMP23AO75900 390 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 ZNF688P0C7X2 276 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 SPINK9Q5DT21 86 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 SLC23A3Q6PIS1 610 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 MRGPRX3Q96LB0 322 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 PTPRDP23468 1912 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 FAM186AA6NE01 2351 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 CX3CL1P78423 397 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 FAM222BQ8WU58 562 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 CHAC1Q9BUX1 264 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 MPC1Q9Y5U8 109 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 SBF1O95248 1867 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 HCFC1P51610 2035 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 PRR35P0CG20 571 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 NPPBP16860 134 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 ADMP35318 185 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 SSTR5P35346 364 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 WNT5AP41221 380 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 METTL26Q96S19 204 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 PRSS27Q9BQR3 290 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 SDF2L1Q9HCN8 221 aa3.29□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 CEACAM18A8MTB9 384 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 PSG3Q16557 428 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 NKG7Q16617 165 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 ORMDL2Q53FV1 153 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 Q6ZSR6 202 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 CLDND2Q8NHS1 167 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 CRYGNQ8WXF5 182 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 COQ2Q96H96 371 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 GNRHR2Q96P88 292 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 SIRT5Q9NXA8 310 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 SEMA5BQ9P283 1151 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 INSIG2Q9Y5U4 225 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 R4GN57 208 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 A0A0G2JMZ2 1700 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 A0A1W2PR48 441 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 LRRC37A2A6NM11 1700 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 TOMM40O96008 361 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 IGHG4P01861 327 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 SSPNQ14714 243 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 OR11H4Q8NGC9 324 aa3.28□□□□□ -1.88
PHC3-215ENST00000495893 ABHD17AQ96GS6 310 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms