RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493536.5

SNHG16-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG16, Length 2,424 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-202ENST00000493536 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.14□□□□□ -1.27
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SNHG16-202ENST00000493536 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.12□□□□□ -1.27
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SNHG16-202ENST00000493536 MARVELD3Q96A59 401 aa7.12□□□□□ -1.27
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SNHG16-202ENST00000493536 TCF19Q9Y242 345 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG16-202ENST00000493536 VPS13CQ709C8 3753 aa7.12□□□□□ -1.27
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SNHG16-202ENST00000493536 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG16-202ENST00000493536 COMMD7Q86VX2 200 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG16-202ENST00000493536 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG16-202ENST00000493536 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SNHG16-202ENST00000493536 CXorf58Q96LI9 332 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG16-202ENST00000493536 OR4C12Q96R67 309 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG16-202ENST00000493536 GINS3Q9BRX5 216 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG16-202ENST00000493536 SIRPDQ9H106 197 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG16-202ENST00000493536 PLEKHA3Q9HB20 300 aa7.11□□□□□ -1.27
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