RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 CCDC140Q96MF4 163 aa6.73□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.73□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.73□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.73□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.73□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 C3orf84H3BNL1 204 aa6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 H3BUA1 57 aa6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 ZP3P21754 424 aa6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 DTYMKP23919 212 aa6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 FCGR2CP31995 323 aa6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 ATP5G2Q06055 141 aa6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 Q6ZS49 121 aa6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 MFSD4AQ8N468 514 aa6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.72□□□□□ -1.33
HDAC3-211ENST00000491581 A0A0G2JLM5 398 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 KBTBD11O94819 623 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 LYL1P12980 280 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 CD36P16671 472 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 CD81P60033 236 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 CBX3Q13185 183 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 OR4A47Q6IF82 309 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 CNIH2Q6PI25 160 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 BEST4Q8NFU0 473 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 CITED4Q96RK1 184 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 ZMAT4Q9H898 229 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 SSR3Q9UNL2 185 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 NSG2Q9Y328 171 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 LYSTQ99698 3801 aa6.71□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 C2orf70A6NJV1 201 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 OR2A4O95047 310 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 S1PR2O95136 353 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 BRI3O95415 125 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 PPYP01298 95 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF735P0CB33 412 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 RRASP10301 218 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 FOLR2P14207 255 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 GUCA2BQ16661 112 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 TM4SF20Q53R12 229 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM17Q86X19 198 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 MMD2Q8IY49 270 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 OR51H1Q8NH63 302 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 USMG5Q96IX5 58 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 OR2A7Q96R45 310 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 NEURL2Q9BR09 285 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 VCX3BQ9H321 246 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 PALMDQ9NP74 551 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 MLXQ9UH92 298 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF320A2RRD8 509 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM213A2RRL7 107 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 FAM223BA6NKX1 122 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 DBX1A6NMT0 343 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 ACTL6BO94805 426 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 DIRAS3O95661 229 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 PMP2P02689 132 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 GALP22466 123 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 PSMB6P28072 239 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 RFX2P48378 723 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 MFAP2P55001 183 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 ARPC4P59998 168 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 HOGA1Q86XE5 327 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 NECAP1Q8NC96 275 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 OR4S2Q8NH73 311 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC3-211ENST00000491581 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.69□□□□□ -1.34
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