RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 SIPA1L1O43166 1804 aa-0.08□□□□□ -2.42
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SENP6-210ENST00000487548 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SENP6-210ENST00000487548 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa-0.09□□□□□ -2.42
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SENP6-210ENST00000487548 COCHO43405 550 aa-0.09□□□□□ -2.42
SENP6-210ENST00000487548 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SENP6-210ENST00000487548 CXCL2P19875 107 aa-0.09□□□□□ -2.42
SENP6-210ENST00000487548 CXCL3P19876 107 aa-0.09□□□□□ -2.42
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SENP6-210ENST00000487548 SSX8Q7RTT4 187 aa-0.13□□□□□ -2.43
SENP6-210ENST00000487548 Q8N814 137 aa-0.13□□□□□ -2.43
SENP6-210ENST00000487548 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa-0.13□□□□□ -2.43
SENP6-210ENST00000487548 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
SENP6-210ENST00000487548 RBP7Q96R05 134 aa-0.13□□□□□ -2.43
SENP6-210ENST00000487548 GREB1Q4ZG55 1949 aa-0.13□□□□□ -2.43
SENP6-210ENST00000487548 TTC21AQ8NDW8 1320 aa-0.13□□□□□ -2.43
SENP6-210ENST00000487548 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
SENP6-210ENST00000487548 EML5Q05BV3 1969 aa-0.14□□□□□ -2.43
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