RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 FBXO36Q8NEA4 188 aa-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR6K2Q8NGY2 324 aa-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR6N2Q8NGY6 317 aa-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 ASB13Q8WXK3 278 aa-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRRT1Q99946 306 aa-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHID1Q9BWS9 393 aa-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHST6Q9GZX3 395 aa-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM222Q9H0R3 208 aa-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 MED28Q9H204 178 aa-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR51E2Q9H255 320 aa-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 BLZF1Q9H2G9 400 aa-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 MS4A12Q9NXJ0 267 aa-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZFP30Q9Y2G7 519 aa-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 V9GYY9 64 aa-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRC2Q9UBG0 1479 aa-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 TJP1Q07157 1748 aa-0.55□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 DNAJC13O75165 2243 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 SIPA1L1O43166 1804 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAV7A0A075B6U4 112 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDIPTO14735 213 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR2T1O43869 369 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 GADD45AP24522 165 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 DAPP51397 102 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 TPI1P60174 286 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 MIAQ16674 131 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACSM3Q53FZ2 586 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q6ZT83 130 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM86AQ8N2M4 240 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC22A24Q8N4F4 322 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM75Q8N9X5 138 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR8G5Q8NG78 346 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR2AE1Q8NHA4 323 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM45AQ8TCE6 357 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC127Q96BQ5 260 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 ABHD14BQ96IU4 210 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 HAUS4Q9H6D7 363 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 TAAR3PQ9P1P4 343 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00527Q9UJ94 153 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADGRL2O95490 1459 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 E9PCH4 1651 aa-0.56□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 ABCC12Q96J65 1359 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A0J9YW62 118 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 SUPT3HB4E1H0 165 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 H0YC42 278 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 ORC5O43913 435 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 MPZL2O60487 215 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 STK16O75716 305 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 VAPBO95292 243 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 ALDH3A1P30838 453 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 GABRA2P47869 451 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 BEX3Q00994 111 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 GDF5OSQ5U4N7 250 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAHD1Q6P587 224 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPATA12Q7Z6I5 190 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 MT1MQ8N339 61 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARHGAP18Q8N392 663 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF675Q8TD23 568 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPS4Y2Q8TD47 263 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 AQP3Q92482 292 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDKL2Q92772 493 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 TOP1MTQ969P6 601 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 FBXL15Q9H469 300 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 DNAJC12Q9UKB3 198 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 TIMM9Q9Y5J7 89 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRP6O75581 1613 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 UNC13CQ8NB66 2214 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 FLT4P35916 1363 aa-0.57□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 GOLGA3Q08378 1498 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A087WUU8 490 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 C5orf49A4QMS7 147 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIM64CA6NLI5 447 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 M0R2T5 61 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 INE1O15225 51 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 CRXO43186 299 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP8B1O43520 1251 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 MT2AP02795 61 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR13C7P0DN81 318 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 BGNP21810 368 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 GALP22466 123 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 CA5AP35218 305 aa-0.58□□□□□ -2.5
CACNA2D1-211ENST00000486539 TAS2R20P59543 309 aa-0.58□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms