RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485621.1

TRAPPC10-211, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-211ENST00000485621 EDDM3AQ14507 147 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 SPHARQ15513 63 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 GRK1Q15835 563 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 C1orf100Q5SVJ3 147 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 GPR157Q5UAW9 335 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 LIPKQ5VXJ0 399 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 PRSS48Q7RTY5 328 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 Q8IYB0 196 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 STX19Q8N4C7 294 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
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TRAPPC10-211ENST00000485621 OR5D14Q8NGL3 314 aa3.26□□□□□ -1.89
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TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
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TRAPPC10-211ENST00000485621 BANF2Q9H503 90 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF286AQ9HBT8 521 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM138Q9NPI0 162 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 ACOT13Q9NPJ3 140 aa3.26□□□□□ -1.89
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TRAPPC10-211ENST00000485621 RAB26Q9ULW5 256 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 FOXJ3Q9UPW0 622 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 LINC00312Q9Y6C7 94 aa3.26□□□□□ -1.89
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TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM231BA6NCW3 169 aa3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 LY6LH3BQJ8 138 aa3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 C15orf65H3BRN8 121 aa3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 H3BUX3 64 aa3.25□□□□□ -1.89
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TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF861PO60384 105 aa3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 CLN5O75503 358 aa3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 CLPXO76031 633 aa3.25□□□□□ -1.89
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TRAPPC10-211ENST00000485621 IGLV1-47P01700 117 aa3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 CD2P06729 351 aa3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF728P0DKX0 622 aa3.25□□□□□ -1.89
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TRAPPC10-211ENST00000485621 SERPINA2P20848 420 aa3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 SSTR5P35346 364 aa3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 CBX5P45973 191 aa3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 RAB13P51153 203 aa3.25□□□□□ -1.89
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TRAPPC10-211ENST00000485621 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa3.25□□□□□ -1.89
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TRAPPC10-211ENST00000485621 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 GDPD3Q7L5L3 318 aa3.25□□□□□ -1.89
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TRAPPC10-211ENST00000485621 OSR2Q8N2R0 312 aa3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 TEX29Q8N6K0 151 aa3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 SUMF2Q8NBJ7 301 aa3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR11H6Q8NGC7 330 aa3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 UBALD1Q8TB05 177 aa3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 CORO2AQ92828 525 aa3.25□□□□□ -1.89
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TRAPPC10-211ENST00000485621 LINC00574Q9H8X3 128 aa3.25□□□□□ -1.89
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TRAPPC10-211ENST00000485621 VWFP04275 2813 aa3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM14DPA8MWL7 114 aa3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 UBE2CO00762 179 aa3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 SH2D1BO14796 132 aa3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 BET1O15155 118 aa3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC31A2O15432 143 aa3.24□□□□□ -1.89
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