RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484908.1

ATP6AP1-208, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, human

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6AP1-208	ENST00000484908	HMX3	A6NHT5	357 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	IFNA6	P05013	189 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SPATA2	Q9UM82	520 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SCAND1	P57086	179 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ARPC4	P59998	168 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CD81	P60033	236 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	LCE6A	A0A183	80 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PPP5D1	E7EU14	171 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	HRAS	P01112	189 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ZNF735	P0CB33	412 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SDC2	P34741	201 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	KIR2DS2	P43631	304 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	MSMO1	Q15800	293 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	BEST4	Q8NFU0	473 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	NEURL2	Q9BR09	285 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	C2orf70	A6NJV1	201 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ZNF785	A8K8V0	405 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908		E7EUB6	86 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	LGALS9	O00182	355 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TPPP	O94811	219 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	DHFR	P00374	187 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CRYGC	P07315	174 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	KLK9	Q2XQG4	91 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	HOGA1	Q86XE5	327 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908		Q9H521	79 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ETV7	Q9Y603	341 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908		A0A0A6YYH2	397 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908		A0A1B0GW64	132 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908		A6NJ64	397 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	NDUFB8	O95169	186 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR2C1	O95371	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	FOLR2	P14207	255 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CTRB1	P17538	263 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PSMB6	P28072	239 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	FCGR2C	P31995	323 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	MXD1	Q05195	221 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SSX9	Q7RTT3	188 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	GPHB5	Q86YW7	130 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR4A5	Q8NH83	315 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	BET1L	Q9NYM9	111 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ATP6V1G2	O95670	118 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PPY	P01298	95 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CD7	P09564	240 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	AREG	P15514	252 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ZNF773	Q6PK81	442 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	GPHA2	Q96T91	129 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TNFSF12	O43508	249 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATP6AP1-208	ENST00000484908	HLA-G	P17693	338 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATP6AP1-208	ENST00000484908	EDN2	P20800	178 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ARL3	P36405	182 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CATR1	Q13166	79 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATP6AP1-208	ENST00000484908	IDNK	Q5T6J7	187 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR4A47	Q6IF82	309 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CCDC140	Q96MF4	163 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATP6AP1-208	ENST00000484908	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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