RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 MMD2Q8IY49 270 aa13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 IGLC2P0DOY2 106 aa13.61□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 IGLC3P0DOY3 106 aa13.61□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 OR5A2Q8NGI9 324 aa13.61□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 RAMP3O60896 148 aa13.61□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00205P59089 165 aa13.61□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 RPL19P84098 196 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 DOLPP1Q86YN1 238 aa13.61□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 RAB29O14966 203 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 GPX1P07203 203 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 WNT2P09544 360 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 LHX2P50458 406 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 RPL31P62899 125 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 OR2M7Q8NG81 312 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 RCHY1Q96PM5 261 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 RPH3ALQ9UNE2 315 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 C3orf79P0CE67 100 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 RIPPLY3P57055 190 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 RPEL1Q2QD12 228 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 SLC45A2Q9UMX9 530 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 ITGB1BP1O14713 200 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 FOXL1Q12952 345 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 MIC13Q5XKP0 118 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 COX11Q9Y6N1 276 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 NEURL1O76050 574 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-13P01766 116 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-7P01780 117 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 CD99P14209 185 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 RAC2P15153 192 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 TNFSF4P23510 183 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 PCBD1P61457 104 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 ABCA1O95477 2261 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 ODAMA1E959 279 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 TIMP3P35625 211 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 GFRA1P56159 465 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 ORAOV1Q8WV07 137 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB108AA8MXU0 73 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 PSG1P11464 419 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 TSPOP30536 169 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM164Q5U3C3 297 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 NHLRC2Q8NBF2 726 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 HIPK2Q9H2X6 1198 aa13.59□□□□□ -0.23
CCSAP-204ENST00000483092 FGF12P61328 243 aa13.58□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 RFESDQ8TAC1 157 aa13.58□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 OR2D2Q9H210 308 aa13.58□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 GABRA2P47869 451 aa13.58□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00310P59036 64 aa13.58□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 PCSK4Q6UW60 755 aa13.58□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 TTTY12Q9BZ98 90 aa13.58□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 CA1P00915 261 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM11P17152 192 aa13.58□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 CDKN1BP46527 198 aa13.58□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 AARDQ4LEZ3 155 aa13.58□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 DRAM1Q8N682 238 aa13.58□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 NINJ1Q92982 152 aa13.58□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-43DP0DP04 118 aa13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 GCNT2Q8N0V5 402 aa13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM251Q8N6I4 163 aa13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 SLC24A4Q8NFF2 622 aa13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 IL36GQ9NZH8 169 aa13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 B4GALT7Q9UBV7 327 aa13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 TPRP12270 2363 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 LRP5LA4QPB2 252 aa13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 CLDN14O95500 239 aa13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 CAMPP49913 170 aa13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF585BQ52M93 769 aa13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 PRR27Q6MZM9 219 aa13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM144Q7Z5S9 345 aa13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 IL36BQ9NZH7 164 aa13.57□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 M0R2Z0 102 aa13.56□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 S1PR2O95136 353 aa13.56□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 TNFSF15O95150 251 aa13.56□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHA3Q9HB20 300 aa13.56□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 YPEL1O60688 119 aa13.56□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 YPEL2Q96QA6 119 aa13.56□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 FAM173AQ9BQD7 235 aa13.56□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 ROS1P08922 2347 aa13.56□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 NUDT3O95989 172 aa13.56□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 TCTAP57738 103 aa13.56□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.2 ms