RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481116.5

ABCF3-215, Transcript of ATP binding cassette subfamily F member 3, humanhuman

TSL 4

Gene ABCF3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3-215ENST00000481116 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
ABCF3-215ENST00000481116 KIR2DS2P43631 304 aa9.9□□□□□ -0.82
ABCF3-215ENST00000481116 TAS2R46P59540 309 aa9.9□□□□□ -0.82
ABCF3-215ENST00000481116 SPCS2Q15005 226 aa9.9□□□□□ -0.82
ABCF3-215ENST00000481116 MSMO1Q15800 293 aa9.9□□□□□ -0.82
ABCF3-215ENST00000481116 MZT2AQ6P582 158 aa9.9□□□□□ -0.82
ABCF3-215ENST00000481116 ZBTB34Q8NCN2 500 aa9.9□□□□□ -0.82
ABCF3-215ENST00000481116 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa9.9□□□□□ -0.82
ABCF3-215ENST00000481116 MOB3AQ96BX8 217 aa9.9□□□□□ -0.82
ABCF3-215ENST00000481116 CMTM3Q96MX0 182 aa9.9□□□□□ -0.82
ABCF3-215ENST00000481116 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
ABCF3-215ENST00000481116 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.9□□□□□ -0.82
ABCF3-215ENST00000481116 SORL1Q92673 2214 aa9.89□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 TRAV3A0A0B4J244 114 aa9.89□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 A0A0G2JLM5 398 aa9.89□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 TEX22C9J3V5 150 aa9.89□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 S1PR2O95136 353 aa9.89□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 HRASP01112 189 aa9.89□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 RLN1P04808 185 aa9.89□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 ZNF45Q02386 682 aa9.89□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 CATR1Q13166 79 aa9.89□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 AADACL3Q5VUY0 350 aa9.89□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 OR4A47Q6IF82 309 aa9.89□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 COL7A1Q02388 2944 aa9.89□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 M0QYG6 137 aa9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 LY86O95711 162 aa9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 ACSM6Q6P461 480 aa9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 HAPLN4Q86UW8 402 aa9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 OR6F1Q8NGZ6 308 aa9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 VSTM2AQ8TAG5 236 aa9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 SPIN2AQ99865 258 aa9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 MIXL1Q9H2W2 232 aa9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 SCPEP1Q9HB40 452 aa9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 HRASLSQ9HDD0 168 aa9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 AKIP1Q9NQ31 210 aa9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 EXTL2Q9UBQ6 330 aa9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 KLK11Q9UBX7 282 aa9.88□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 CGB1A6NKQ9 187 aa9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 CTDSP2O14595 271 aa9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.837e-8■□□□□ 11
ABCF3-215ENST00000481116 OR2J3O76001 311 aa9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 BRI3O95415 125 aa9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 HPRT1P00492 218 aa9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 REG1AP05451 166 aa9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 ZNF735P0CB33 412 aa9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 AREGP15514 252 aa9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 RCVRNP35243 200 aa9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 TSPAN5P62079 268 aa9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 RHOGP84095 191 aa9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 PHLDA2Q53GA4 152 aa9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 ZNF343Q6P1L6 599 aa9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 ZNF429Q86V71 674 aa9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 OR52I2Q8NH67 350 aa9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 AP3S1Q92572 193 aa9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 USMG5Q96IX5 58 aa9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 BET1LQ9NYM9 111 aa9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa9.86□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 GPR31O00270 319 aa9.86□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 UPK2O00526 184 aa9.86□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 NQO2P16083 231 aa9.86□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 HLA-GP17693 338 aa9.86□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 MAS1LP35410 378 aa9.86□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 LPAR6P43657 344 aa9.86□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 INSL3P51460 131 aa9.86□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 TAS2R31P59538 309 aa9.86□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 LAX1Q8IWV1 398 aa9.86□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 DMBX1Q8NFW5 382 aa9.86□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 ABHD1Q96SE0 405 aa9.86□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 SLC2A9Q9NRM0 540 aa9.86□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 TMEM140Q9NV12 185 aa9.86□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 S4R3C0 116 aa9.86□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 DPPA5A6NC42 116 aa9.85□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 RGS5O15539 181 aa9.85□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 IGHV3-23P01764 117 aa9.85□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 SPNP16150 400 aa9.85□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 ZP3P21754 424 aa9.85□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 F2RP25116 425 aa9.85□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 SYNJ2BPP57105 145 aa9.85□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 ATP5G2Q06055 141 aa9.85□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 ZNF585BQ52M93 769 aa9.85□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 C11orf87Q6NUJ2 197 aa9.85□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 OR4A5Q8NH83 315 aa9.85□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 FCAMRQ8WWV6 532 aa9.85□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 BORCS5Q969J3 196 aa9.85□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ABCF3-215ENST00000481116 OR4C12Q96R67 309 aa9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms