RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 LAX1Q8IWV1 398 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 MMD2Q8IY49 270 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 OR52B4Q8NGK2 314 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 NRG4Q8WWG1 115 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 MGLLQ99685 303 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 ATG5Q9H1Y0 275 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 DUSP21Q9H596 190 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 DPPA5A6NC42 116 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 CGB1A6NKQ9 187 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 IFITM5A6NNB3 132 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 TNFSF12O43508 249 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 FCER2P06734 321 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 CRHBPP24387 322 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 GADD45AP24522 165 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 CDNFQ49AH0 187 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 OR51E2Q9H255 320 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 TAS2R8Q9NYW2 309 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 RYR1P21817 5038 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 TMEM235A6NFC5 223 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 SSX5O60225 188 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 KBTBD11O94819 623 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 S1PR2O95136 353 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 RPA2P15927 270 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 ZNF585BQ52M93 769 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 SLC16A13Q7RTY0 426 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 GPHB5Q86YW7 130 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 OR2A7Q96R45 310 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 TPRKBQ9Y3C4 175 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 LGALS9O00182 355 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 DEDDO75618 318 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 HLA-DQB1P01920 261 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 CLEC3BP05452 202 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 ZNF735P0CB33 412 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 RAB6AP20340 208 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 PSMB6P28072 239 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 GPR183P32249 361 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 TRAM1Q15629 374 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 DEFB135Q30KP9 77 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 C22orf42Q6IC83 251 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A42Q86VD7 318 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 DIRAS3O95661 229 aa8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 CRYGCP07315 174 aa8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 CTRB1P17538 263 aa8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 RAB3BP20337 219 aa8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 PSMD7P51665 324 aa8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 HACD4Q5VWC8 232 aa8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 Q6ZS49 121 aa8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 LYG2Q86SG7 212 aa8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 MFSD4AQ8N468 514 aa8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 OR4S2Q8NH73 311 aa8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 VCXQ9H320 206 aa8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 METTL21EPA6NDL7 271 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 A8MWP6 167 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 PDCD5O14737 125 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 DEFA4P12838 97 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 CD36P16671 472 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 HLA-GP17693 338 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 DTYMKP23919 212 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 MYL9P24844 172 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 OR2B8PP59922 312 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 TNFRSF9Q07011 255 aa8.32□□□□□ -1.08
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