RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468582.5

LAMTOR4-205, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, human

TSL 2 BASIC

Gene LAMTOR4, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LAMTOR4-205	ENST00000468582	MUC7	Q8TAX7	377 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	RYR2	Q92736	4967 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	PPP5D1	E7EU14	171 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	C15orf32	Q32M92	178 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	NECAP1	Q8NC96	275 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582		A8MZ25	164 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	PPY	P01298	95 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	IGHV3-23	P01764	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	AREG	P15514	252 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	FXYD4	P59646	89 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	DIABLO	Q9NR28	239 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	PEMT	Q9UBM1	199 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582		S4R3C0	116 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582		A0A0A6YYH2	397 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	DPPA5	A6NC42	116 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582		A6NJ64	397 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	NDUFB8	O95169	186 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	HRAS	P01112	189 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	ZNF735	P0CB33	412 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	EDN2	P20800	178 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	CASC10	Q5T4H9	136 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	LCN12	Q6JVE5	192 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582		Q8N402	240 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	SULT1C2	O00338	296 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	REG1A	P05451	166 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	MAS1L	P35410	378 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	KIR2DS2	P43631	304 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	OR4A47	Q6IF82	309 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-205	ENST00000468582	TENM2	Q9NT68	2774 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	CGB1	A6NKQ9	187 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	AIRE	O43918	545 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	OR2C1	O95371	312 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	PSMB6	P28072	239 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	MSMO1	Q15800	293 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	HAGH	Q16775	308 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	TMEM17	Q86X19	198 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	CITED4	Q96RK1	184 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	LYST	Q99698	3801 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	TUBA4B	Q9H853	241 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	XRCC3	O43542	346 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	CRYGC	P07315	174 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	CTRB1	P17538	263 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	HLA-G	P17693	338 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	CCDC140	Q96MF4	163 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	BET1L	Q9NYM9	111 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	C2orf70	A6NJV1	201 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	ZNF785	A8K8V0	405 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	LYL1	P12980	280 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	RPA2	P15927	270 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	CBX5	P45973	191 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	OR51H1	Q8NH63	302 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	IFT46	Q9NQC8	304 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	UPK2	O00526	184 aa		13.67	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	13.67	□□□□□ -0.22	4e-10	■■■■□ 21.8
LAMTOR4-205	ENST00000468582	HPRT1	P00492	218 aa		13.67	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	FOLR2	P14207	255 aa		13.67	□□□□□ -0.22
LAMTOR4-205	ENST00000468582	ARL3	P36405	182 aa		13.67	□□□□□ -0.22

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