RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463369.5

SHQ1-203, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SHQ1, Length 2,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-203ENST00000463369 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 H3BP45 60 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 MMP23AO75900 390 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 PPP1CBP62140 327 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF738Q8NE65 137 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 OR4F5Q8NH21 305 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 OR4F4Q96R69 305 aa7.31□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
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SHQ1-203ENST00000463369 IGLC3P0DOY3 106 aa7.3□□□□□ -1.24
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SHQ1-203ENST00000463369 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.3□□□□□ -1.24
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SHQ1-203ENST00000463369 Q6ZPA2 131 aa7.3□□□□□ -1.24
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SHQ1-203ENST00000463369 Q8N976 141 aa7.3□□□□□ -1.24
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SHQ1-203ENST00000463369 TMEM234Q8WY98 164 aa7.3□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 NRGNQ92686 78 aa7.3□□□□□ -1.24
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SHQ1-203ENST00000463369 IGKV1-33P01594 117 aa7.29□□□□□ -1.24
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SHQ1-203ENST00000463369 Q6ZN92 141 aa7.29□□□□□ -1.24
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SHQ1-203ENST00000463369 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.29□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 SGMS2Q8NHU3 365 aa7.29□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
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SHQ1-203ENST00000463369 GPR146Q96CH1 333 aa7.29□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 AJUBAQ96IF1 538 aa7.29□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 OR4C12Q96R67 309 aa7.29□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 RTTNQ86VV8 2226 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 F5H5K5 113 aa7.28□□□□□ -1.24
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