RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460041.5

HOXB-AS3-202, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 728 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCDC140Q96MF4 163 aa7.69□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.69□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OR2A7Q96R45 310 aa7.69□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.69□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.69□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.69□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TMEM213A2RRL7 107 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HMX3A6NHT5 357 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C8orf88P0DMB2 117 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CTRB1P17538 263 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EDN2P20800 178 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PSMB6P28072 239 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARL3P36405 182 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PRSS48Q7RTY5 328 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OR4S2Q8NH73 311 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MARC2Q969Z3 335 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MLXQ9UH92 298 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 A0A075B6Q4 140 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 A0A1B0GW64 132 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DPPA5A6NC42 116 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 E7EUB6 86 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NDUFB8O95169 186 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GALP22466 123 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TNFRSF9Q07011 255 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MSMO1Q15800 293 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CNIH2Q6PI25 160 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 Q6ZWC4 215 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CXorf58Q96LI9 332 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NUPR2A6NF83 97 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HRASP01112 189 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FGF2P09038 288 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RAB3BP20337 219 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CRHBPP24387 322 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OR10A3P58181 314 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RPL8P62917 257 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HACD4Q5VWC8 232 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OR4A5Q8NH83 315 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF320A2RRD8 509 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UBE2CO00762 179 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SCGNO76038 276 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CLEC3BP05452 202 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AREGP15514 252 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYL9P24844 172 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BMI1P35226 326 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CDNFQ49AH0 187 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TM4SF20Q53R12 229 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MFSD4AQ8N468 514 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BET1LQ9NYM9 111 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CXorf65A6NEN9 183 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CGB1A6NKQ9 187 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXB-AS3-202ENST00000460041 J3QRK9 145 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.3 ms