RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451422.1

ANKRD28-204, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 2,485 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-204ENST00000451422 GLRXP35754 106 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 ERVK-16P61578 105 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 GNB2P62879 340 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 BSXQ3C1V8 233 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 Q8N7P7 452 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 CCL13Q99616 98 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 HINT2Q9BX68 163 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 YPEL1O60688 119 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 GYPAP02724 150 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 OPN1MWP04001 364 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 SOD3P08294 240 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 RND2P52198 227 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 SPCS3P61009 180 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 RELBQ01201 579 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 VWC2Q2TAL6 325 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 C1orf185Q5T7R7 199 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 CST9LP1Q5W188 147 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 LYG1Q8N1E2 194 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 YPEL2Q96QA6 119 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 GCM1Q9NP62 436 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 GAB2Q9UQC2 676 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 POLEQ07864 2286 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 C11orf94C9JXX5 98 aa6.21□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 F2RL2O00254 374 aa6.21□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 KLK10O43240 276 aa6.21□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 MMP23AO75900 390 aa6.21□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 LHBP01229 141 aa6.21□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 NPPCP23582 126 aa6.21□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 ATP5G3P48201 142 aa6.21□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 B2MP61769 119 aa6.21□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 MIC13Q5XKP0 118 aa6.21□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.21□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 RHOVQ96L33 236 aa6.21□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 DERL1Q9BUN8 251 aa6.21□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 GGACTQ9BVM4 153 aa6.21□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 TCF19Q9Y242 345 aa6.21□□□□□ -1.41
ANKRD28-204ENST00000451422 SPTA1P02549 2419 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 A0A1W2PPV4 95 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 H7BYZ3 331 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 IGHV1-46P01743 117 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 S100A2P29034 98 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 CFHR2P36980 270 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 CCL8P80075 99 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 S100A12P80511 92 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 PAX5Q02548 391 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 TREML4Q6UXN2 200 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 MGST2Q99735 147 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 MANBALQ9NQG1 85 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 RNF7Q9UBF6 113 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 A0A1W2PPQ1 181 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 VSTM5A8MXK1 200 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 TMEM250H0YL14 139 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 PPP1R2P9O14990 202 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 CHRNA7P36544 502 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 CTAG1AP78358 180 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 PYY3Q5JQD4 70 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 OR4A47Q6IF82 309 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-204ENST00000451422 Q6ZS92 163 aa6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91 ms