RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 NEUROG1Q92886 237 aa9.98□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 DOCK3Q8IZD9 2030 aa9.98□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 M0R3E3 92 aa9.98□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 C1QL1O75973 258 aa9.98□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 HERVK_113P61574 105 aa9.98□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 C3orf36Q3SXR2 165 aa9.98□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 C1orf100Q5SVJ3 147 aa9.98□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 CACFD1Q9UGQ2 172 aa9.98□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 A0A0G2JMZ2 1700 aa9.97□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 LRRC37A2A6NM11 1700 aa9.97□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 A0A1W2PRS3 328 aa9.97□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 LINC01387J3KSC0 135 aa9.97□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 PLAUP00749 431 aa9.97□□□□□ -0.81
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CCBE1-202ENST00000439986 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
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CCBE1-202ENST00000439986 CCDC140Q96MF4 163 aa9.97□□□□□ -0.81
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CCBE1-202ENST00000439986 COX6CP09669 75 aa9.97□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 SRD5A2P31213 254 aa9.97□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.97□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 OR11H1Q8NG94 326 aa9.97□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 OR11H2Q8NH07 326 aa9.97□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 AQP3Q92482 292 aa9.97□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 C14orf144Q96I85 54 aa9.97□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 CD8AP01732 235 aa9.97□□□□□ -0.81
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CCBE1-202ENST00000439986 RNF144BQ7Z419 303 aa9.97□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.97□□□□□ -0.81
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CCBE1-202ENST00000439986 WNT16Q9UBV4 365 aa9.97□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 WIPI2Q9Y4P8 454 aa9.97□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa9.97□□□□□ -0.81
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CCBE1-202ENST00000439986 FAM186AA6NE01 2351 aa9.97□□□□□ -0.81
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CCBE1-202ENST00000439986 LCTP09848 1927 aa9.96□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa9.96□□□□□ -0.81
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CCBE1-202ENST00000439986 PAGE4O60829 102 aa9.96□□□□□ -0.81
CCBE1-202ENST00000439986 PPYP01298 95 aa9.96□□□□□ -0.81
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CCBE1-202ENST00000439986 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.96□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 IL11P20809 199 aa9.96□□□□□ -0.82
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CCBE1-202ENST00000439986 MMDQ15546 238 aa9.96□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 AQP10Q96PS8 301 aa9.96□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF665Q9H7R5 613 aa9.96□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 RNF7Q9UBF6 113 aa9.96□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 MYOZ3Q8TDC0 251 aa9.96□□□□□ -0.82
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CCBE1-202ENST00000439986 RP1P56715 2156 aa9.96□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa9.95□□□□□ -0.82
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CCBE1-202ENST00000439986 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 MDP1Q86V88 176 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 APCSP02743 223 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 SMIM10L1P0DMW3 83 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 CRISP2P16562 243 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 SMIM10Q96HG1 83 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 A0A0U1RRA0 63 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF253O75346 499 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF441Q8N8Z8 693 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 Q9N2K0 584 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 CELA2AP08217 269 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 LY6EQ16553 131 aa9.95□□□□□ -0.82
CCBE1-202ENST00000439986 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.95□□□□□ -0.82
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