RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 ZBTB34Q8NCN2 500 aa11.54□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 SECTM1Q8WVN6 248 aa11.54□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 CITED4Q96RK1 184 aa11.54□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 SPATA25Q9BR10 227 aa11.54□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 ADAM30Q9UKF2 790 aa11.54□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 TNCP24821 2201 aa11.54□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 NPIPB5A8MRT5 1133 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 BMPR1BO00238 502 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 CLEC2LP0C7M8 214 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 CBX5P45973 191 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 RPL8P62917 257 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 CATR1Q13166 79 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 HOGA1Q86XE5 327 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 OR13F1Q8NGS4 319 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 SLC2A9Q9NRM0 540 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 RYR3Q15413 4870 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-206ENST00000431413 HMX3A6NHT5 357 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 GGCTO75223 188 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 PPYP01298 95 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 IFNA6P05013 189 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 NEDD8Q15843 81 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 SSX9Q7RTT3 188 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 CROCCP3Q8IVE0 287 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 LAX1Q8IWV1 398 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 SPAG16Q8N0X2 631 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 GVQW1Q8N7I0 195 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 OR5H6Q8NGV6 325 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 OR4A5Q8NH83 315 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 DYNLRB2Q8TF09 96 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 BORCS5Q969J3 196 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 ISOC1Q96CN7 298 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 SLC25A38Q96DW6 304 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 AUNIPQ9H7T9 357 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 CCL28Q9NRJ3 127 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 FBXL7Q9UJT9 491 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 TEX22C9J3V5 150 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 TNFSF12O43508 249 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 ZNF735P0CB33 412 aa11.51□□□□□ -0.57
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HERC3-206ENST00000431413 SLC5A7Q9GZV3 580 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 RNF167Q9H6Y7 350 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 HRASLSQ9HDD0 168 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 SLC2A8Q9NY64 477 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 BET1LQ9NYM9 111 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 TPPPO94811 219 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 HPRT1P00492 218 aa11.5□□□□□ -0.57
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HERC3-206ENST00000431413 HLA-GP17693 338 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 PSMB6P28072 239 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 MECP2P51608 486 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 BRWD1-AS2P59051 145 aa11.5□□□□□ -0.57
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HERC3-206ENST00000431413 FAM106AQ4KMX7 169 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 OR4A47Q6IF82 309 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 OR5AP2Q8NGF4 316 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 CD300LFQ8TDQ1 290 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 GIMAP1Q8WWP7 306 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa11.5□□□□□ -0.57
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HERC3-206ENST00000431413 IFT46Q9NQC8 304 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 IZUMO1RA6ND01 250 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 PPP5D1E7EU14 171 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 LGALS9O00182 355 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 OR2C1O95371 312 aa11.49□□□□□ -0.57
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HERC3-206ENST00000431413 ARL3P36405 182 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 FXYD4P59646 89 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 CD81P60033 236 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 HERV-K104P61576 105 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
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HERC3-206ENST00000431413 GPHA2Q96T91 129 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 COMMD5Q9GZQ3 224 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 VCX3AQ9NNX9 186 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 C2orf70A6NJV1 201 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 E7EUB6 86 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 SULT1C2O00338 296 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 CYB5BO43169 146 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 XRCC3O43542 346 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 PTHLHP12272 177 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 FOLR2P14207 255 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 AREGP15514 252 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 CTRB1P17538 263 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 GUCA2BQ16661 112 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 DEFB114Q30KQ6 69 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 AADACL3Q5VUY0 350 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 CTRB2Q6GPI1 263 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-206ENST00000431413 CLEC19AQ6UXS0 136 aa11.48□□□□□ -0.57
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