RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCNKO75909 580 aa13.54□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRYGBP07316 175 aa13.54□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 CNTFRP26992 372 aa13.54□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZRM9 215 aa13.54□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 AKAP14Q86UN6 197 aa13.54□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOXRED2Q8IWF2 684 aa13.54□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SSMEM1Q8WWF3 244 aa13.54□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLSCR3Q9NRY6 295 aa13.54□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRNDQ9UKY0 176 aa13.54□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIGLEC9Q9Y336 463 aa13.54□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 PITX3O75364 302 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2F2O95006 317 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR9G9P0C7N8 305 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SRD5A1P18405 259 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 F2RL1P55085 397 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAP2BP61225 183 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD83Q01151 205 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 RELBQ01201 579 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 AARDQ4LEZ3 155 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBLN7Q53RD9 439 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 C16orf82Q7Z2V1 217 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF429Q86V71 674 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R27Q86WC6 154 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR1S1Q8NH92 325 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHIAQ9BZP6 476 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 FKBP11Q9NYL4 201 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 GSKIPQ9P0R6 139 aa13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYO9AB2RTY4 2548 aa13.52□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 A6NDX4 124 aa13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 C15orf61A6NNL5 157 aa13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM90A26D6RGX4 464 aa13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL8P62917 257 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL15RAQ13261 267 aa13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLGLAQ15195 96 aa13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 C5orf64Q2M2E5 130 aa13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 MMD2Q8IY49 270 aa13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4D5Q8NGN0 318 aa13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A33Q9BSK2 321 aa13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXL15Q9H469 300 aa13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZFP57Q9NU63 452 aa13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM14BQ9NUH8 114 aa13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 POMT1Q9Y6A1 747 aa13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 FGF16O43320 207 aa13.51□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV4-59P01825 116 aa13.51□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAS1LP35410 378 aa13.51□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRSS8Q16651 343 aa13.51□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa13.51□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM86BQ8N661 226 aa13.51□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa13.51□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa13.51□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 NSG2Q9Y328 171 aa13.51□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 MOB4Q9Y3A3 225 aa13.51□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV3A0A0B4J244 114 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 M0QZK8 103 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PFDN1O60925 122 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2B8PP59922 312 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q8N9W7 124 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5B3Q8NH48 314 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR52E5Q8NH55 327 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ST6GAL2Q96JF0 529 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEURL2Q9BR09 285 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSPB7Q9UBY9 170 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 VPREB3Q9UKI3 123 aa13.5□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACTL6BO94805 426 aa13.49□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ID3Q02535 119 aa13.49□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 FGL1Q08830 312 aa13.49□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 LY6EQ16553 131 aa13.49□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM219Q86XT9 240 aa13.49□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCTE3Q8IZS6 198 aa13.49□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa13.49□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 RASL11BQ9BPW5 248 aa13.49□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 COMMD5Q9GZQ3 224 aa13.49□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 TPSG1Q9NRR2 321 aa13.49□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR51B2Q9Y5P1 312 aa13.49□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZANQ9Y493 2812 aa13.48□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 INAFM1C9JVW0 142 aa13.48□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ST8SIA3O43173 380 aa13.48□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFNA17P01571 189 aa13.48□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 HLA-DRB1P01911 266 aa13.48□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 MBPP02686 304 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PET100P0DJ07 73 aa13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.7 ms