RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384121.1

RNU6-890P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 890, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-890P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-890P-201ENST00000384121 RAB4BP61018 213 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 MITD1Q8WV92 249 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 ACER3Q9NUN7 267 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 CLEC2DQ9UHP7 191 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 GREB1Q4ZG55 1949 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 CHD5Q8TDI0 1954 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 PEAK1Q9H792 1746 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 F5H5K5 113 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 H0YIV9 168 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 OR5F1O95221 314 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 SULT1A3P0DMM9 295 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 SULT1A4P0DMN0 295 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 NQO2P16083 231 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 HOXA6P31267 233 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 RPL30P62888 115 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 AAED1Q7RTV5 226 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 RAB2BQ8WUD1 216 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 NDEL1Q9GZM8 345 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 TTC21AQ8NDW8 1320 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-890P-201ENST00000384121 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 OR2T8A6NH00 312 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 FADS1O60427 444 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 CFL1P23528 166 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 KDELR1P24390 212 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 RAB31Q13636 194 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 GNA13Q14344 377 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 LRRC6Q86X45 466 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 CDRT4Q8N9R6 151 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 SMIM12Q96EX1 92 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 OR1I1O60431 355 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 PSMD7P51665 324 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 H2BFSP57053 126 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 CNBPP62633 177 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 PDE6HQ13956 83 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 KCNJ8Q15842 424 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 OOSP2Q86WS3 158 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 LINC00311Q8N616 119 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 WFDC11Q8NEX6 87 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 AGR3Q8TD06 166 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 FAM210AQ96ND0 272 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 PSME2Q9UL46 239 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 RABL2BQ9UNT1 228 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 EML6Q6ZMW3 1958 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 C2orf70A6NJV1 201 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 K7ERQ8 282 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 LEPROTO15243 131 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 NSA2O95478 260 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 LIMS3P0CW19 117 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 LIMS4P0CW20 117 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 PSG9Q00887 426 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 MPV17LQ2QL34 196 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 TMEM239Q8WW34 195 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 TMEM56Q96MV1 263 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 TMEM208Q9BTX3 173 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 RAB1BQ9H0U4 201 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 PARVAQ9NVD7 372 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 TTC41PQ6P2S7 1318 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 CACNA1CQ13936 2221 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 ASAH2BP0C7U1 165 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 OR4D2P58180 307 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 RAB8AP61006 207 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 FABP5Q01469 135 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 Q6ZS92 163 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZNF826PQ6ZT77 177 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZNF550Q7Z398 422 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 C11orf40Q8WZ69 217 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 CMTM5Q96DZ9 223 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 SLC50A1Q9BRV3 221 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 E9PCH4 1651 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 COL4A5P29400 1685 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 HEATR5AQ86XA9 2040 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 DENND4CQ5VZ89 1909 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 A0A1B0GW15 77 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 KCNK1O00180 336 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 ATP5G1P05496 136 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 HLA-DMBP28068 263 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 CSN1S1P47710 185 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-890P-201ENST00000384121 HPCAP84074 193 aa-0.77□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms