RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 COA4Q9NYJ1 87 aa14.26□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 FAM96BQ9Y3D0 163 aa14.26□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 UPK2O00526 184 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 OR2F2O95006 317 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 MOSP00540 346 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 PET100P0DJ07 73 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 ID3Q02535 119 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 MMDQ15546 238 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 ZNF546Q86UE3 836 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 RBKSQ9H477 322 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 C15orf61A6NNL5 157 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 KBTBD11O94819 623 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 OPN1MWP04001 364 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 RLN2P04090 185 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 SLC25A4P12235 298 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 ARHGDIBP52566 201 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 UBE2KP61086 200 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 TNFRSF9Q07011 255 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 PSG5Q15238 335 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 IL17RELQ6ZVW7 336 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 CLCC1Q96S66 551 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 AIFM2Q9BRQ8 373 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 FBXL15Q9H469 300 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 CREBBPQ92793 2442 aa14.24□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.24□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 IFNA17P01571 189 aa14.24□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 CXCL2P19875 107 aa14.24□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 LGALS7P47929 136 aa14.24□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 F2RL1P55085 397 aa14.24□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 KRTAP1-1Q07627 177 aa14.24□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa14.24□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.24□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 HINT2Q9BX68 163 aa14.24□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 BET1LQ9NYM9 111 aa14.24□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.24□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 NUP50Q9UKX7 468 aa14.24□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 HSPB11Q9Y547 144 aa14.24□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 MSGN1A6NI15 193 aa14.23□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 CEBPZOSA8MTT3 80 aa14.23□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 L7N2F9 121 aa14.23□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 CHST1O43916 411 aa14.23□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 TMEM11P17152 192 aa14.23□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 BRS3P32247 399 aa14.23□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 VAMP2P63027 116 aa14.23□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 PJVKQ0ZLH3 352 aa14.23□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 TNFSF18Q9UNG2 199 aa14.23□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 OR51B2Q9Y5P1 312 aa14.23□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 H3BP45 60 aa14.22□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 SYNGR2O43760 224 aa14.22□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 TMEM50AO95807 157 aa14.22□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 PLGLAQ15195 96 aa14.22□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.22□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 VSTM2AQ8TAG5 236 aa14.22□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.22□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 MFFQ9GZY8 342 aa14.22□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 ZFP57Q9NU63 452 aa14.22□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 LYL1P12980 280 aa14.22□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 NANPQ8TBE9 248 aa14.22□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 C11orf1Q9H5F2 150 aa14.22□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 TMEM14BQ9NUH8 114 aa14.22□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 PRNDQ9UKY0 176 aa14.22□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 TCF19Q9Y242 345 aa14.22□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 RNF222A6NCQ9 220 aa14.21□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 HMSDA8MTL9 139 aa14.21□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 FAM90A26D6RGX4 464 aa14.21□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 E5RGE8 158 aa14.21□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 RRHO14718 337 aa14.21□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 NBR2O15453 112 aa14.21□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 FSHBP01225 129 aa14.21□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 FBP1P09467 338 aa14.21□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 CAV2P51636 162 aa14.21□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 GNB1P62873 340 aa14.21□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 RPL8P62917 257 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 CLEC9AQ6UXN8 241 aa14.21□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 YAE1D1Q9NRH1 226 aa14.21□□□□□ -0.13
LTV1-201ENST00000367576 FAM24AA6NFZ4 105 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 CRYGBP07316 175 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 FAM106CPP0CH98 169 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 PAX9P55771 341 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 DEFB112Q30KQ8 113 aa14.2□□□□□ -0.14
LTV1-201ENST00000367576 TMEM65Q6PI78 240 aa14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99 ms