RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365375.1

RNU6-728P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 728, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-728P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-728P-201ENST00000365375 TSPAN32Q96QS1 320 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 CIB1Q99828 191 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 SYT4Q9H2B2 425 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 RMND1Q9NWS8 449 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 SNX10Q9Y5X0 201 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 NPATQ14207 1427 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 MTUS2Q5JR59 1369 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 CSMD3Q7Z407 3707 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR6C6A6NF89 314 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 MRASO14807 208 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR1I1O60431 355 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 SC5DO75845 299 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 METTL15P1P0C7V9 234 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 MSNP26038 577 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 RAB4BP61018 213 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 HIKESHIQ53FT3 197 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 MESTQ5EB52 335 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 GPHB5Q86YW7 130 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 ATOH7Q8N100 152 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 COPS4Q9BT78 406 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 TIMM22Q9Y584 194 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 TTC21AQ8NDW8 1320 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 C21orf140B9A014 251 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 M0R381 172 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 FABP7O15540 132 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 FXYD2P54710 66 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 SNAP25P60880 206 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 LPCAT4Q643R3 524 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZNF826PQ6ZT77 177 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 TMEM156Q8N614 296 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 LINC00311Q8N616 119 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 C3orf56Q8N813 242 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 TOP1MTQ969P6 601 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 NDEL1Q9GZM8 345 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 TLNRD1Q9H1K6 362 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 IFNKQ9P0W0 207 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 PTPN13Q12923 2485 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 BCORL1Q5H9F3 1711 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 SIP14410 1827 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 FUOMA2VDF0 154 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 C10orf142B7Z368 130 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 hCG_2039718K7EN88 272 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 SLC22A1O15245 554 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 CCL25O15444 150 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 SYNGR1O43759 233 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 SNX4O95219 450 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 DNAL4O96015 105 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 RCVRNP35243 200 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 BEX3Q00994 111 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 DMTNQ08495 405 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 BSXQ3C1V8 233 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 PID1Q7Z2X4 250 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZNF550Q7Z398 422 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 SYS1Q8N2H4 156 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 MRAP2Q96G30 205 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR7D2Q96RA2 312 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 ACER3Q9NUN7 267 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 NUPR2A6NF83 97 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 EFCAB9A8MZ26 197 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 KRT7P08729 469 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 RANBP1P43487 201 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 C1DQ13901 141 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 CAVIN4Q5BKX8 364 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZNF676Q8N7Q3 588 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZNF321PQ8N8H1 164 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 MS4A6EQ96DS6 147 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR8D2Q9GZM6 311 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 DCSTAMPQ9H295 470 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 TMBIM4Q9HC24 238 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 XAGE1AQ9HD64 81 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 STMN3Q9NZ72 180 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 EMC3Q9P0I2 261 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 CD300AQ9UGN4 299 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 LAMA5O15230 3695 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR5F1O95221 314 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-728P-201ENST00000365375 NSA2O95478 260 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-728P-201ENST00000365375 ASAH2BP0C7U1 165 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-728P-201ENST00000365375 BGNP21810 368 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-728P-201ENST00000365375 F8A1P23610 371 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-728P-201ENST00000365375 BCAP31P51572 246 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-728P-201ENST00000365375 ATP5J2P56134 94 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR4D2P58180 307 aa-1.1□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms