RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 CACNA1BQ00975 2339 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 PSPNO60542 156 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 PSG1P11464 419 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 FOLR2P14207 255 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 NTF3P20783 257 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 RAB32Q13637 225 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 C11orf71Q6IPW1 123 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 C20orf204Q6ZNR8 217 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 NECAP2Q9NVZ3 263 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 EHFQ9NZC4 300 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CADP27708 2225 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CD8AP01732 235 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 GABRA2P47869 451 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 PAX2Q02962 417 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 RHEBQ15382 184 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 FFAR4Q5NUL3 377 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TEX36Q5VZQ5 186 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CST9LP1Q5W188 147 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR4S2Q8NH73 311 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CFHR4Q92496 578 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 LHX4Q969G2 390 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PPR1 153 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OOEPA6NGQ2 149 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TMEM178BH3BS89 294 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SLC17A3O00476 420 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ZNF205O95201 554 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 HPXP02790 462 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 IL13RA1P78552 427 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 STUMQ69YW2 141 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 GAPTQ8N292 157 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR13C8Q8NGS7 320 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR1S1Q8NH92 325 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 DCUN1D4Q92564 292 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TMEM106BQ9NUM4 274 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 RFNGQ9Y644 331 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SOD3P08294 240 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ZNF266Q14584 549 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 DTX2Q86UW9 622 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CCL17Q92583 94 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ARL11Q969Q4 196 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 PHYHIPLQ96FC7 376 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SMPXQ9UHP9 88 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 PPIAL4AQ9Y536 164 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TPRP12270 2363 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 GYPAP02724 150 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 DANCRP0C864 163 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SCGB1A1P11684 91 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SSTR5P35346 364 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TMEM128Q5BJH2 165 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SLC35E4Q6ICL7 350 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 C5orf24Q7Z6I8 188 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 COQ2Q96H96 371 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SNX22Q96L94 193 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 GAFA1Q96PS6 74 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 DERL1Q9BUN8 251 aa5.03□□□□□ -1.6
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CCR6-201ENST00000341935 F5H768 121 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 ZNF737O75373 536 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 SCTP09683 121 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 OR5H8P0DN80 308 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 KIR2DS4P43632 304 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
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CCR6-201ENST00000341935 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 DHRS11Q6UWP2 260 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 LHFPL1Q86WI0 220 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 RNF152Q8N8N0 203 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 ZDHHC22Q8N966 263 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 DEFB108BQ8NET1 73 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 PTH2Q96A98 100 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 MRAP2Q96G30 205 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 SDSLQ96GA7 329 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
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