RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 C22orf46C9J442 243 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 UPK2O00526 184 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 ARG1P05089 322 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 GNB2P62879 340 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 ATP6V1FQ16864 119 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 FAM71F2Q6NXP2 309 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 HIPK2Q9H2X6 1198 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 UQCC1Q9NVA1 299 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 IFNA10P01566 189 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 OR8U8P0C7N1 319 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 ADCYAP1P18509 176 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 HNF4GQ14541 408 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
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ACTB-201ENST00000331789 VSIRQ9H7M9 311 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-201ENST00000331789 OR51B2Q9Y5P1 312 aa14.53□□□□□ -0.08
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ACTB-201ENST00000331789 RRHO14718 337 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 CD5P06127 495 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 ZNF137PP52743 207 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 CCL20P78556 96 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 TMEM177Q53S58 311 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 LY6G5BQ8NDX9 201 aa14.52□□□□□ -0.09
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ACTB-201ENST00000331789 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 CFAP46Q8IYW2 2715 aa14.52□□□□□ -0.09
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ACTB-201ENST00000331789 OPN1MWP04001 364 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 PRB1P04280 392 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 PRRX1P54821 245 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 DEFA5Q01523 94 aa14.51□□□□□ -0.09
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ACTB-201ENST00000331789 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 TMEM170AQ8WVE7 144 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 HARBI1Q96MB7 349 aa14.51□□□□□ -0.09
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ACTB-201ENST00000331789 LY86O95711 162 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 COX7A1P24310 79 aa14.51□□□□□ -0.09
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ACTB-201ENST00000331789 USP24Q9UPU5 2620 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 KBTBD11O94819 623 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 IGLV1-47P01700 117 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 LIPFP07098 398 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 IL3RAP26951 378 aa14.5□□□□□ -0.09
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ACTB-201ENST00000331789 VWC2Q2TAL6 325 aa14.5□□□□□ -0.09
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ACTB-201ENST00000331789 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 F8W036 122 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 RBP4P02753 201 aa14.49□□□□□ -0.09
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ACTB-201ENST00000331789 ETV3LQ6ZN32 361 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 PDPNQ86YL7 162 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 Q8N7P7 452 aa14.49□□□□□ -0.09
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ACTB-201ENST00000331789 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 PNKDQ8N490 385 aa14.49□□□□□ -0.09
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ACTB-201ENST00000331789 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 TNFRSF14Q92956 283 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 LOC105371242A0A075B767 164 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 FAM157AC9JC47 383 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 SFTA3P0C7M3 94 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-201ENST00000331789 RNF224P0DH78 156 aa14.48□□□□□ -0.09
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