RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 FUT9Q9Y231 359 aa5.64□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 PLXNB2O15031 1838 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 A6NDN8 102 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 KNCNA6PVL3 124 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 RER1O15258 196 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 HIST1H2BKO60814 126 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 EPPINO95925 133 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 TNFP01375 233 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 HIST1H2BJP06899 126 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 CA6P23280 308 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 HIST1H2BOP23527 126 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 NFYBP25208 207 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 HIST1H2BBP33778 126 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 ATP5G3P48201 142 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 THBS3P49746 956 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 HIST1H2BDP58876 126 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 HIST1H2BCP62807 126 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 FOXC1Q12948 553 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 CTF1Q16619 201 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 ZNF793Q6ZN11 406 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 HEBP1Q9NRV9 189 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 ATAD5Q96QE3 1844 aa5.63□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 A0A087X0T9 212 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 CD300LBA8K4G0 201 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 HAX1O00165 279 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 SIX6O95475 246 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 CD38P28907 300 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 PFN2P35080 140 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 SNCAP37840 140 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 TMEM207Q6UWW9 146 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 OR2A1Q8NGT9 310 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 OR8S1Q8NH09 359 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 TMEM191AQ9H0A3 160 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 OR10A2Q9H208 303 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 SEC61A2Q9H9S3 476 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 PDFQ9HBH1 243 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 WASHC3Q9Y3C0 194 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 U3KQE9 123 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 MAST2Q6P0Q8 1798 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 CDH23Q9H251 3354 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 ODAMA1E959 279 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 J3QT63 122 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 TAX1BP3O14907 124 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 CTLA4P16410 223 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 GDF5P43026 501 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 GP2P55259 537 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 HGFACQ04756 655 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 HES1Q14469 280 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 TMEM30BQ3MIR4 351 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 TTC32Q5I0X7 151 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 Q6AWC8 147 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 LCN12Q6JVE5 192 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 OR4C16Q8NGL9 310 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 C4orf45Q96LM5 186 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 TMEM100Q9NV29 134 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 NTMQ9P121 344 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 IGLC7A0M8Q6 106 aa5.61□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 C8orf87E5RJ46 101 aa5.61□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 LY6LH3BQJ8 138 aa5.61□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 NCR2O95944 276 aa5.61□□□□□ -1.51
RRN3-202ENST00000327307 HLA-DRB1P01911 266 aa5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms