RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MPDU1O75352 247 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PSG1P11464 419 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRR27Q6MZM9 219 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MOB1BQ7L9L4 216 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DRAM1Q8N682 238 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRDM14Q9GZV8 571 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ODAMA1E959 279 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IGLL1P15814 213 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TBR1Q16650 682 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM58AQ8N1B3 248 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 R4GN57 208 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRAV24A0A0B4J272 114 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 J3QR06 171 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AMY1AP04745 511 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PATE4P0C8F1 98 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GPM6AP51674 278 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PCBD1P61457 104 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIAA1644Q3SXP7 199 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 VHLLQ6RSH7 139 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM19A2Q8N3H0 131 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SCCPDHQ8NBX0 429 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GTF3C1Q12789 2109 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 B4GALT1P15291 398 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OPRK1P41145 380 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CEACAM21Q3KPI0 293 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR4A47Q6IF82 309 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LCN12Q6JVE5 192 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZFAND5O76080 213 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LINC00869P0C866 280 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EDDM3BP56851 147 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DKK1O94907 266 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF883P0CG24 379 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NTF3P20783 257 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CLDN18P56856 261 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DEFB125Q8N687 156 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR8B2Q96RD0 313 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAMP3O60896 148 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 G6PCP35575 357 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF596Q8TC21 504 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR2D2Q9H210 308 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OSTCQ9NRP0 149 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DLL3Q9NYJ7 618 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RRHO14718 337 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CDIPTO14735 213 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCL4P13236 92 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM71F2Q6NXP2 309 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C15orf62A8K5M9 175 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WISP2O76076 250 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ACP1P24666 158 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARF6P62330 175 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C18orf32Q8TCD1 76 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FOXB1Q99853 325 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EML6Q6ZMW3 1958 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAB29O14966 203 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AREGP15514 252 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 S100A7P31151 101 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RPS16P62249 146 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IL11RAQ14626 422 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MPV17L2Q567V2 206 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FGFBP3Q8TAT2 258 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ST20Q9HBF5 79 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SYNGR1O43759 233 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MT-CO2P00403 227 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GCHFRP30047 84 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UBE2G1P62253 170 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GAGE12BA1L429 117 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 APCSP02743 223 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 Q56UQ5 140 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR2T8A6NH00 312 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CLDN14O95500 239 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms