RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 PRB1P04280 392 aa18.49■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa18.49■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PPH5 198 aa18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 GNB2P62879 340 aa18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 HNF4GQ14541 408 aa18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 HARBI1Q96MB7 349 aa18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 CLCC1Q96S66 551 aa18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 HIPK2Q9H2X6 1198 aa18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 IFNA10P01566 189 aa18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 ADCYAP1P18509 176 aa18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 SNCAP37840 140 aa18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 LY6G5BQ8NDX9 201 aa18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 ONECUT1Q9UBC0 465 aa18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 UPK2O00526 184 aa18.47■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 ATP6V1FQ16864 119 aa18.47■□□□□ 0.55
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VSTM4-201ENST00000298454 TMEM147Q9BVK8 224 aa18.47■□□□□ 0.55
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VSTM4-201ENST00000298454 UQCC1Q9NVA1 299 aa18.47■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 OR51B2Q9Y5P1 312 aa18.47■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa18.47■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 RRHO14718 337 aa18.47■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 IGLV1-47P01700 117 aa18.47■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 OR8U8P0C7N1 319 aa18.47■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 LHX4Q969G2 390 aa18.47■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 OPN1MWP04001 364 aa18.46■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 LIPFP07098 398 aa18.46■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 OPN1MW2P0DN77 364 aa18.46■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 OPN1MW3P0DN78 364 aa18.46■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 COX7A1P24310 79 aa18.46■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM177Q53S58 311 aa18.46■□□□□ 0.55
VSTM4-201ENST00000298454 VSIRQ9H7M9 311 aa18.46■□□□□ 0.55
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VSTM4-201ENST00000298454 LY86O95711 162 aa18.45■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 CD5P06127 495 aa18.45■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 HLA-DRB5Q30154 266 aa18.45■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM170AQ8WVE7 144 aa18.45■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 TNFRSF14Q92956 283 aa18.45■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
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VSTM4-201ENST00000298454 BET1LQ9NYM9 111 aa18.45■□□□□ 0.54
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VSTM4-201ENST00000298454 RNF224P0DH78 156 aa18.45■□□□□ 0.54
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VSTM4-201ENST00000298454 PDPNQ86YL7 162 aa18.45■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 OR4C13Q8NGP0 309 aa18.45■□□□□ 0.54
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VSTM4-201ENST00000298454 SPSB3Q6PJ21 355 aa18.44■□□□□ 0.54
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VSTM4-201ENST00000298454 WASHC3Q9Y3C0 194 aa18.44■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa18.44■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 H2AFB1P0C5Y9 115 aa18.44■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
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VSTM4-201ENST00000298454 DEFA5Q01523 94 aa18.44■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 VWC2Q2TAL6 325 aa18.44■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 ETV3LQ6ZN32 361 aa18.44■□□□□ 0.54
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VSTM4-201ENST00000298454 F8W036 122 aa18.42■□□□□ 0.54
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VSTM4-201ENST00000298454 FGF7P21781 194 aa18.42■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 GUK1Q16774 197 aa18.42■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 ATRAIDQ6UW56 229 aa18.42■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 COMMD1Q8N668 190 aa18.42■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 RITA1Q96K30 269 aa18.42■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa18.42■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 LOC105371242A0A075B767 164 aa18.42■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa18.42■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PPE2 198 aa18.42■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PR64 198 aa18.42■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PRV1 198 aa18.42■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 ELLP55199 621 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 SERF2P84101 59 aa18.42■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 DPPA3Q6W0C5 159 aa18.42■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 PNKDQ8N490 385 aa18.42■□□□□ 0.54
VSTM4-201ENST00000298454 BEND2Q8NDZ0 799 aa18.42■□□□□ 0.54
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