RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 SRPXP78539 464 aa8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 ASB13Q8WXK3 278 aa8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 WFDC1Q9HC57 220 aa8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 ONECUT1Q9UBC0 465 aa8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 IGSF23A1L1A6 192 aa8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 C11orf42Q8N5U0 333 aa8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 ITPR2Q14571 2701 aa8.97□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 DLEU1O43261 78 aa8.97□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 WNT2P09544 360 aa8.97□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 PET100P0DJ07 73 aa8.97□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 PPT1P50897 306 aa8.97□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 CATR1Q13166 79 aa8.97□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.97□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 POMT1Q9Y6A1 747 aa8.97□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.97□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 TSTD3H0UI37 97 aa8.97□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 OR9G9P0C7N8 305 aa8.97□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 NQO2P16083 231 aa8.97□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 DTX2Q86UW9 622 aa8.97□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 STOML3Q8TAV4 291 aa8.97□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa8.97□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.97□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 PAX9P55771 341 aa8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 VAMP2P63027 116 aa8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 PYY3Q5JQD4 70 aa8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 HEPN1Q6WQI6 88 aa8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 PNKDQ8N490 385 aa8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 OR10X1Q8NGY0 326 aa8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 CORO2AQ92828 525 aa8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 R3HDM4Q96D70 268 aa8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 TOLLIPQ9H0E2 274 aa8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 PRDM13Q9H4Q3 707 aa8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 NAV3Q8IVL0 2385 aa8.96□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 RNF212BA8MTL3 300 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 E5RGE8 158 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 NDUFS8O00217 210 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 RAB29O14966 203 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 IFNA10P01566 189 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 CT45A6P0DMU7 189 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 CT45A5P0DMU8 189 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 CT45A7P0DMV0 189 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 LYL1P12980 280 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 LCN2P80188 198 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 KLRD1Q13241 179 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF345Q14585 488 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 ABHD12Q8N2K0 398 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 AQP10Q96PS8 301 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 S1PR3Q99500 378 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.96□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 IGHV1-8P0DP01 117 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 DLX6P56179 175 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 GNB2P62879 340 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 ID3Q02535 119 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 OR2C3Q8N628 320 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 RAB1CQ92928 201 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 RITA1Q96K30 269 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 SPIN2AQ99865 258 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 NOTCH2Q04721 2471 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM238C9JI98 176 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 ITGB1BP1O14713 200 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 EREGO14944 169 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 PITX3O75364 302 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 LINC00614P0C842 121 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 C4BPBP20851 252 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 TIMD4Q96H15 378 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms