RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264350.7

HERC5-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC5, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5-201ENST00000264350 TMEM170AQ8WVE7 144 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC5-201ENST00000264350 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC5-201ENST00000264350 ASCL3Q9NQ33 180 aa11.34□□□□□ -0.59
HERC5-201ENST00000264350 KALRNO60229 2985 aa11.33□□□□□ -0.59
HERC5-201ENST00000264350 MLNRO43193 412 aa11.33□□□□□ -0.6
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HERC5-201ENST00000264350 FAM27E3Q08E93 113 aa11.33□□□□□ -0.6
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HERC5-201ENST00000264350 MARCH11A6NNE9 402 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
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HERC5-201ENST00000264350 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 GBGT1Q8N5D6 347 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 COQ2Q96H96 371 aa11.32□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 C11orf94C9JXX5 98 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
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HERC5-201ENST00000264350 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa11.31□□□□□ -0.6
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HERC5-201ENST00000264350 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa11.31□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 TDGF1P3P51864 188 aa11.31□□□□□ -0.6
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HERC5-201ENST00000264350 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
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HERC5-201ENST00000264350 CXXC4Q9H2H0 198 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 ERVK11-1P61568 191 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 WDR82Q6UXN9 313 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 ACP7Q6ZNF0 438 aa11.3□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 NPCDR1Q9BY65 106 aa11.3□□□□□ -0.6
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HERC5-201ENST00000264350 THBS3P49746 956 aa11.3□□□□□ -0.6
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HERC5-201ENST00000264350 GP6Q9HCN6 339 aa11.3□□□□□ -0.6
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HERC5-201ENST00000264350 C17orf112F2Z3M2 114 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 GCGP01275 180 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 PRDX2P32119 198 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 TFPI2P48307 235 aa11.29□□□□□ -0.6
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HERC5-201ENST00000264350 CCL8P80075 99 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 ZNF320A2RRD8 509 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 WNT2P09544 360 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 GNG10P50151 68 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 CNN1P51911 297 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 OR2V2Q96R30 315 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 DIRC2Q96SL1 478 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 AGMATQ9BSE5 352 aa11.29□□□□□ -0.6
HERC5-201ENST00000264350 HSPB7Q9UBY9 170 aa11.29□□□□□ -0.6
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