RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 MMD2Q8IY49 270 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 CABLES2Q9BTV7 478 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 MLXQ9UH92 298 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 S4R3C0 116 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 HMX3A6NHT5 357 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 GSTT2P0CG29 244 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 GSTT2BP0CG30 244 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 DUTP33316 252 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 CDK10Q15131 360 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM106AQ4KMX7 169 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 TM4SF20Q53R12 229 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 BTNL8Q6UX41 500 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC19AQ6UXS0 136 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 C19orf35Q6ZS72 473 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 DHRSXQ8N5I4 330 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 UXS1Q8NBZ7 420 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 MAFIPQ8WZ33 124 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 DMRT1Q9Y5R6 373 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC17A2O00624 439 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFRSF9Q07011 255 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 PLAC9Q5JTB6 97 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 GPHB5Q86YW7 130 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 PCLOQ9Y6V0 5065 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM213A2RRL7 107 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00473A8K010 186 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRY2O43597 315 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 FCGR3AP08637 254 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 UCHL1P09936 223 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 BMI1P35226 326 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 APOC4P55056 127 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 CLDN12P56749 244 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB135Q30KP9 77 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 MND1Q9BWT6 205 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 FCGR3BO75015 233 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4A47Q6IF82 309 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1L6Q8NGR2 347 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 CD37P11049 281 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 WFDC3Q8IUB2 231 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM203Q969S6 136 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC140Q96MF4 163 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 GFI1Q99684 422 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 KMT2AQ03164 3969 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 J3QRK9 145 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 DENRO43583 198 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2B11Q5JQS5 317 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB3CQ96E17 227 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAH10Q8IVF4 4471 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 A8MWP6 167 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 LAIR2Q6ISS4 152 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZWC4 215 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC38A6Q8IZM9 456 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM217Q8N7C4 229 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM3DQ96BQ1 224 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A075B6Q4 140 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 NPIPB5A8MRT5 1133 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX22C9J3V5 150 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 DIRAS3O95661 229 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 UBQLN2Q9UHD9 624 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 DHFRP00374 187 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 CDK1P06493 297 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 GNAO1P09471 354 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 MED22Q15528 200 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 C2orf76Q3KRA6 126 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF585BQ52M93 769 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD9Q7L273 389 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 UFD1Q92890 307 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 OR51E2Q9H255 320 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNK7Q9Y2U2 307 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV25A0A0B4J276 109 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 SPHARQ15513 63 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 LIPKQ5VXJ0 399 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2C3Q8N628 320 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2CO00762 179 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 TALDO1P37837 337 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G7Q13093 441 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 LGALS9CQ6DKI2 356 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 STPG3Q8N7X2 389 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 MARC2Q969Z3 335 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 FANCD2OSQ96PS1 177 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL6IP5O75915 188 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFA4P12838 97 aa20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 264.1 ms