RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	MED28	Q9H204	178 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0B4J2A0	478 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	RRAS	P10301	218 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD1B	P29016	333 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	G6PC	P35575	357 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	HES1	Q14469	280 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SSX9	Q7RTT3	188 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	TEX29	Q8N6K0	151 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	HARBI1	Q96MB7	349 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	MARCH11	A6NNE9	402 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCS	O14618	274 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SHOX	O15266	292 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV1-5	P01602	117 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRS3	P32247	399 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	AKR1C2	P52895	323 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	FCN2	Q15485	313 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEC22A	Q96IW7	307 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	RHOV	Q96L33	236 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	MPTX1	A8MV57	137 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLXNB1	O43157	2135 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	CXCL3	P19876	107 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM177	Q53S58	311 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL22RA2	Q969J5	263 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	R3HDM4	Q96D70	268 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SSX3	Q99909	188 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	MOS	P00540	346 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	NQO2	P16083	231 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	HNF1A	P20823	631 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	VDAC1	P21796	283 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZFP69	Q49AA0	526 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIFO	Q8TCI5	191 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	COMMD9	Q9P000	198 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0G2JRQ6	117 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	GOSR2	O14653	212 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SIX6	O95475	246 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM106CP	P0CH98	169 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNTFR	P26992	372 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAB18	Q9NP72	206 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM160	Q9NX00	188 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM25E	A8MYX2	175 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	HRAS	P01112	189 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	NMS	Q5H8A3	153 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576		H3BUX3	64 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGLV2-23	P01705	113 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	LGALS7	P47929	136 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	DYNLT3	P51808	116 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	F2RL1	P55085	397 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	H2BFS	P57053	126 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERVK-16	P61578	105 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	EBI3	Q14213	229 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR4A47	Q6IF82	309 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q6ZRM9	215 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR10C1	Q96KK4	312 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC25A17	O43808	307 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATG12	O94817	140 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFNA21	P01568	189 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576		P0C879	139 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM11	P17152	192 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	MMD	Q15546	238 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM140	Q9NV12	185 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	C5orf51	A6NDU8	294 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	HMX3	A6NHT5	357 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV4-59	P01825	116 aa		7.32	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms