RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	C9orf170	A2RU37	121 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691		M0QZK8	103 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	SPDEF	O95238	335 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	NQO2	P16083	231 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	VAMP1	P23763	118 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	DHRS2	Q13268	280 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	HNF4G	Q14541	408 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM187	Q14656	261 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	POU2AF1	Q16633	256 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	SP6	Q3SY56	376 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	LYG2	Q86SG7	212 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	HARBI1	Q96MB7	349 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	STAB1	Q9NY15	2570 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691		A0A0B4J2A0	478 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	FGF16	O43320	207 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	SPN	P16150	400 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	LGI3	Q8N145	548 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	LRTM2	Q8N967	370 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	TEX45	Q8NA69	505 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	NBR2	O15453	112 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	TCF21	O43680	179 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	NDUFA3	O95167	84 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	RAB25	P57735	213 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	UBE2K	P61086	200 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	ERVK-16	P61578	105 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF695	Q8IW36	515 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	COQ8A	Q8NI60	647 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	RITA1	Q96K30	269 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	RHOV	Q96L33	236 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	KIAA1456	Q9P272	454 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	CUBN	O60494	3623 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	RRH	O14718	337 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	S1PR2	O95136	353 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	IGLV2-23	P01705	113 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	F2RL1	P55085	397 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	PSG5	Q15238	335 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	MMD	Q15546	238 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	LY6E	Q16553	131 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	OR4A5	Q8NH83	315 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	MITD1	Q8WV92	249 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	R3HDM4	Q96D70	268 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	PHB2	Q99623	299 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	BEX1	Q9HBH7	125 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	MARCH11	A6NNE9	402 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	OR2A4	O95047	310 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	KRAS	P01116	189 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	IGKV1-39	P01597	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	IGKV1D-39	P04432	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	FGF2	P09038	288 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM219	Q86XT9	240 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	FAM219A	Q8IW50	185 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	SEC22A	Q96IW7	307 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	OR2A7	Q96R45	310 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	CHIA	Q9BZP6	476 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	ESM1	Q9NQ30	184 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	BET1L	Q9NYM9	111 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TBCD-223	ENST00000576691	CRYGB	P07316	175 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TBCD-223	ENST00000576691	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TBCD-223	ENST00000576691	VDAC1	P21796	283 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TBCD-223	ENST00000576691	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TBCD-223	ENST00000576691	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TBCD-223	ENST00000576691	FBLN7	Q53RD9	439 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TBCD-223	ENST00000576691	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TBCD-223	ENST00000576691	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TBCD-223	ENST00000576691		Q8N9W7	124 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TBCD-223	ENST00000576691	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TBCD-223	ENST00000576691	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TBCD-223	ENST00000576691	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TBCD-223	ENST00000576691	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TBCD-223	ENST00000576691	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TBCD-223	ENST00000576691	SLC25A17	O43808	307 aa		13.38	□□□□□ -0.27

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