RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	CD69	Q07108	199 aa		16.74	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	CDK10	Q15131	360 aa		16.74	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		16.74	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	ACSM6	Q6P461	480 aa		16.74	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	16.74	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		16.74	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	16.74	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	16.73	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	16.73	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	FCGR2C	P31995	323 aa		16.73	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	ARPC4	P59998	168 aa		16.73	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	16.73	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	MSMO1	Q15800	293 aa		16.73	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	TNXA	Q16473	311 aa		16.73	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		16.73	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	MFSD4A	Q8N468	514 aa		16.73	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	16.73	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0G2JLM5	398 aa		16.72	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		16.72	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	SAP30	O75446	220 aa		16.72	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	APELA	P0DMC3	54 aa		16.72	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		16.72	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		16.72	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		16.72	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		16.72	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	16.72	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	GPHA2	Q96T91	129 aa		16.72	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		16.72	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	16.72	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		16.72	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	16.72	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	PPY	P01298	95 aa		16.71	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	DYRK1A	Q13627	763 aa		16.71	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	MMD2	Q8IY49	270 aa		16.71	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		16.71	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4S2	Q8NH73	311 aa		16.71	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	PHB2	Q99623	299 aa		16.71	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		16.71	■□□□□ 0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	16.7	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	FCER2	P06734	321 aa		16.7	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	OR9G9	P0C7N8	305 aa		16.7	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	CBX5	P45973	191 aa		16.7	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		16.7	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		16.7	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		16.7	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		16.7	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		16.7	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		16.7	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	COA4	Q9NYJ1	87 aa		16.7	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		16.7	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFA5	Q01523	94 aa		16.7	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		16.7	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	16.7	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		16.7	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		16.7	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	USMG5	Q96IX5	58 aa		16.7	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		16.69	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	KBTBD11	O94819	623 aa		16.69	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2A4	O95047	310 aa		16.69	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	16.69	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		16.69	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		16.69	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2A7	Q96R45	310 aa		16.69	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SPIN2A	Q99865	258 aa		16.69	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		16.69	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		16.69	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		16.68	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTL6B	O94805	426 aa		16.68	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SPN	P16150	400 aa		16.68	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ZP3	P21754	424 aa		16.68	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TAS2R20	P59543	309 aa		16.68	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF45	Q02386	682 aa		16.68	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		16.68	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		16.68	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		16.68	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	16.68	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		16.67	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFSF12	O43508	249 aa		16.67	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV12-3	P01733	135 aa		16.67	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	NCS1	P62166	190 aa		16.67	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		16.67	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		16.67	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	16.67	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GW64	132 aa		16.66	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX22	C9J3V5	150 aa		16.66	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200		E7EUB6	86 aa		16.66	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	MPPED1	O15442	326 aa		16.66	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	16.66	■□□□□ 0.26	7e-17	■■■■■ 38.8
PPP4C-205	ENST00000563200	PRH1	P02810	166 aa		16.66	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	NAT1	P18440	290 aa		16.66	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	KIR2DS2	P43631	304 aa		16.66	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		16.66	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		16.66	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		16.66	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4C12	Q96R67	309 aa		16.66	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		16.65	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	LY86	O95711	162 aa		16.65	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	HRAS	P01112	189 aa		16.65	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	16.65	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	16.65	■□□□□ 0.26

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