RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560243.5

RABGGTA-216, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-216ENST00000560243 MSGN1A6NI15 193 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 SEC14L6B5MCN3 397 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 SLC22A5O76082 557 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 TRGV3P03979 118 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 ELK1P19419 428 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 RFX2P48378 723 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 ALDH3B2P48448 385 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 SLURP1P55000 103 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 CDK10Q15131 360 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 TNXAQ16473 311 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 C10orf55Q5SWW7 151 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 POC5Q8NA72 575 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 ACOT12Q8WYK0 555 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 DCUN1D4Q92564 292 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 SLC5A7Q9GZV3 580 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 EHFQ9NZC4 300 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 SCOCQ9UIL1 159 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 RAMP3O60896 148 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 APOA1P02647 267 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 PMP2P02689 132 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 OR8U8P0C7N1 319 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 NAT1P18440 290 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 PRSS3P35030 304 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 RORCP51449 518 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 PYHIN1Q6K0P9 492 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 TMEM17Q86X19 198 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 OR4S2Q8NH73 311 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 DPF1Q92782 380 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 RHOVQ96L33 236 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 GPR61Q9BZJ8 451 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 SORL1Q92673 2214 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 SULT1C2O00338 296 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 MYOD1P15172 320 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 DYRK1AQ13627 763 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 DHRS11Q6UWP2 260 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 SSX9Q7RTT3 188 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 GPX8Q8TED1 209 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 PHB2Q99623 299 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 SLA2Q9H6Q3 261 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 A0A1B0GW64 132 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 E7EUB6 86 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 LINC01619G3V211 115 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 OR2A4O95047 310 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 PRH1P02810 166 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 HLA-DMAP28067 261 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 CD40LGP29965 261 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 GNRHRP30968 328 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 HRH1P35367 487 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 HERV-K104P61576 105 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 DGCR2P98153 550 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 SPCS2Q15005 226 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 MSMO1Q15800 293 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 C19orf35Q6ZS72 473 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 GPR141Q7Z602 305 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 MMD2Q8IY49 270 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 SPAG16Q8N0X2 631 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 OR5H2Q8NGV7 314 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 OR51H1Q8NH63 302 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 CMTM3Q96MX0 182 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 OR2A7Q96R45 310 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 COA4Q9NYJ1 87 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTA-216ENST00000560243 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTA-216ENST00000560243 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTA-216ENST00000560243 HMX3A6NHT5 357 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTA-216ENST00000560243 H3BUA1 57 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTA-216ENST00000560243 OVOL1O14753 267 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTA-216ENST00000560243 MPPED1O15442 326 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTA-216ENST00000560243 KBTBD11O94819 623 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTA-216ENST00000560243 TRBV12-3P01733 135 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTA-216ENST00000560243 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RABGGTA-216ENST00000560243 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RABGGTA-216ENST00000560243 OR9G9P0C7N8 305 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTA-216ENST00000560243 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RABGGTA-216ENST00000560243 ECI1P42126 302 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTA-216ENST00000560243 TAS2R46P59540 309 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTA-216ENST00000560243 ZNF45Q02386 682 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTA-216ENST00000560243 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms