RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 RAB2BQ8WUD1 216 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 MOB3AQ96BX8 217 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 NECAP2Q9NVZ3 263 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 EHFQ9NZC4 300 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 A3GALT2U3KPV4 340 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 A0A1W2PN81 502 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 NUDT19A8MXV4 375 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 M0QYG6 137 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 SULT1C2O00338 296 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 SHOXO15266 292 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 APELAP0DMC3 54 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 CHRNA7P36544 502 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 MYCNOSP40205 109 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 CBX5P45973 191 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 LGALS7P47929 136 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 ARPC4P59998 168 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF45Q02386 682 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 PLGLAQ15195 96 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 AKIRIN2Q53H80 203 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 KCTD9Q7L273 389 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 LHFPL1Q86WI0 220 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC5A7Q9GZV3 580 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 TEX22C9J3V5 150 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 IGKV1-39P01597 117 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 IGKV1D-39P04432 117 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 MSMO1Q15800 293 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM17Q86X19 198 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 TEX45Q8NA69 505 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 OR5T1Q8NG75 326 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 ARPC1AQ92747 370 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 ADTRPQ96IZ2 230 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 MS4A10Q96PG2 267 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 OR5B12Q96R08 314 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 SCPEP1Q9HB40 452 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 MTFP1Q9UDX5 166 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 DMRT1Q9Y5R6 373 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 TGP01266 2768 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 DBX1A6NMT0 343 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM25AB3EWG3 89 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM25CB3EWG5 89 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM25GB3EWG6 89 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 CCL24O00175 119 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 CD3DP04234 171 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 RRASP10301 218 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 TNFSF8P32971 234 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 VAX1Q5SQQ9 334 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 FAAP20Q6NZ36 180 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF66Q6ZN08 573 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 RHOVQ96L33 236 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 UBE2E2Q96LR5 201 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 BCL7BQ9BQE9 202 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 IFT46Q9NQC8 304 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 SCOCQ9UIL1 159 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 HMX3A6NHT5 357 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 MSGN1A6NI15 193 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC22A5O76082 557 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 S1PR2O95136 353 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 TRBV12-3P01733 135 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 PRH1P02810 166 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 CD74P04233 296 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 RUNX1Q01196 453 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 POU2AF1Q16633 256 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 RTL8BQ17RB0 113 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM65Q6PI78 240 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 SPAG16Q8N0X2 631 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 OR5H2Q8NGV7 314 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 A0A087WW49 117 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 IGHV3-11P01762 117 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 RPA2P15927 270 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 RCVRNP35243 200 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF79Q15937 498 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 ACTBL2Q562R1 376 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 OR4A47Q6IF82 309 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 MZT2AQ6P582 158 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 SSX9Q7RTT3 188 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 OR11H1Q8NG94 326 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms